砂藓抗高温相关基因RcDAPDC的克隆及表达分析

发布时间：2021-12-18 01:15

　　二氨基庚二酸脱羧酶（diaminnopimelate decarboxylase, DAPDC）是合成赖氨酸的关键酶,在生物体的生命活动及非生物胁迫应答过程中发挥重要作用。本研究在砂藓（Racomitrium canescens）高温胁迫蛋白质组数据中发现一个表达量上调的DAPDC蛋白质,将其命名为RcDAPDC,并对编码此的基因全长CDS序列进行了克隆,还对此基因进行了基本的生物信息学分析,同时对砂藓在60℃高温胁迫、脱水和复水条件下的表达变化进行了分析。RcDAPDC基因CDS全长1 521 bp,编码蛋白质的氨基酸数为506,相对分子质量为55.9 kD,理论等电点为5.83,不稳定指数为36.91,是一个稳定蛋白,亲水性的平均值（GRAVY）为-0.169,预测该蛋白质为亲水性蛋白,不具有跨膜结构域。实时荧光定量PCR结果显示,RcDAPDC基因在60℃高温处理1 h时表达量最高;RcDAPDC基因在干旱和复水过程中呈现差异性表达,推测RcDAPDC不仅可能参与砂藓的抗高温胁迫反应,而且还可能参与砂藓的干旱胁迫响应和复水过程。本研究对进一步研究砂藓RcDAPDC基因的生物学功能... 

【文章来源】：分子植物育种. 2020,18(24)北大核心CSCD

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

RcDAPDC的亲疏水性预测

RcDAPDC的三级结构预测

RcDAPDC的系统进化分析

【参考文献】：
期刊论文
[1]砂藓抗旱相关基因RcSOD的克隆及表达分析[J]. 沙伟,蒋卓君,张梅娟,马天意.  基因组学与应用生物学. 2019(05)
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硕士论文
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[3]高温胁迫对苹果生理效应及耐热性诱导的研究[D]. 庞勇.西北农林科技大学 2004



本文编号：3541330