百子莲类枯草杆菌蛋白酶基因ApSBT的克隆及表达特性分析

发布时间：2021-12-25 06:01

　　类枯草杆菌蛋白酶（subtilisin-like proteases, SBT）是一类与植物发育、防御反应相关的多功能丝氨酸蛋白酶。本文以百子莲（Agapanthus praecox ssp.orientalis）胚性愈伤组织为供试材料,利用RACE技术克隆出全长的ApSBT基因为2 316 bp,编码771个氨基酸。预测ApSBT蛋白为82.69 kDa,是从属于Peptidases S8家族的亲水蛋白。同源序列对比分析可知,百子莲ApSBT蛋白与棕榈科和禾本科等单子叶植物的SBT遗传进化关系较近。百子莲丛生芽经过4种单一的非生物（渗透、盐、氧化及内质网）胁迫处理12和24 h后,实时荧光定量PCR检测发现ApSBT基因的相对表达量对4种胁迫均有响应,其中胁迫12 h时的表达量最高,分别为对照的12.00、4.25、3.20和2.50倍。通过单一胁迫实验发现,在10 mmol·L-1 H2O2诱导下的转基因拟南芥幼苗死亡率高达78.57%,说明ApSBT主要响应了氧化胁迫。 

【文章来源】：植物生理学报. 2020,56(12)北大核心CSCD

【文章页数】：11 页

【部分图文】：

百子莲Ap SBT基因3′-RACE (A)、5′-RACE (B)及编码区全长(C)扩增产物

百子莲Ap SBT基因的核苷酸、编码氨基酸序列(A)及蛋白的PFam结构域预测(B)

利用SOPMA在线网站进行蛋白的二级结构分析表明,百子莲Ap SBT主要由无规卷曲(379个氨基酸)、延伸主链(173个氨基酸)、α螺旋(166个氨基酸)和β折叠(53个氨基酸)构成,分别占氨基酸序列总数的49.16%、22.44%、21.53%和6.87%,其中无规卷曲所占比例最高;少量的β折叠散布在延伸主链附近,α螺旋、延伸主链和无规卷曲贯穿于整个氨基酸肽链。图4 百子莲Ap SBT与其他植物SBT蛋白系统进化树

【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
[1]ROS诱导的氧化胁迫与细胞凋亡对百子莲愈伤组织超低温保存细胞活性的影响机制[D]. 张洁.上海交通大学 2015
[2]蓝百合快速繁殖技术的研究[D]. 范现丽.上海交通大学 2009



本文编号：3551916