通过生物信息学分析鉴定乳腺癌相关的异常甲基化差异表达基因及其功能

发布时间：2022-01-02 15:20

　　一、研究背景乳腺癌是全世界女性中最常见的恶性肿瘤,也是女性癌症相关死亡的主要原因。尽管乳腺癌的筛查、诊断和治疗有所改善,但预后仍然很差。发生在癌变早期的基因特异性甲基化的改变有助于癌症的早期检测和预防。虽然有研究报道某些基因在乳腺癌中存在异常的DNA甲基化修饰,但这种基于基因表达谱芯片和甲基化芯片的综合网络图谱及其功能通路仍然尚未揭示。全球乳腺癌发病率的持续上升,迫切需要寻找更敏感、更特异的乳腺癌发生发展相关的生物标记物,用于早期准确诊断和患者的预后分层。二、研究目的本研究旨在通过综合的生物信息学分析鉴定乳腺癌发病相关的异常甲基化差异表达的生物标志物并探讨相关的功能作用。三、研究方法首先,在GEO数据库下载基因表达谱芯片GSE45827和DNA甲基化芯片GSE32393的数据。GSE45827数据中包含了 130例乳腺癌组织样本和11个正常乳腺组织。甲基化芯片GSE32393数据中共有137例样本,其中包括114例乳腺癌组织样本和23个癌旁的正常组织。使用GE02R在线工具筛选GSE45827的差异表达基因（P-value<0.05且|log FC≥2.0）。对于甲基化芯片GSE... 

【文章来源】：南方医科大学广东省

【文章页数】：65 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

基因表达谱芯片05麟5827的数据信息.Fi创.2一1Th.d.I面Isofge”.

一基因甲基化芯片GSE32393的数据信息.Fi即拍2一Thedetailsof郎nemotkylationprOfilingdataofGSE32393

Ｏｎｃｏｇｅｎｅ?ＴＳＧ??图３－２确定异常甲基化修饰下差异表达的癌基因和抑癌基因。（Ａ）１８９个低甲基化修饰并且??表达上调的基因，其中１８个为癌基因。（Ｂ）２６３个高甲基化修饰并且表达下调的基因，其中??２１个抑癌基因。??Ｆｉｇｕｒｅ?３－２?Ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｏｆ?ａｂｃｒｒａｎｔＫ?ｍｃｔｌｎ?ｌａｔｅｄ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ?ｏｎｃｏｇｅｎｅｓ?ａｎｄ?ｔｕｍｏｒ??ｓｕｐｐｒｅｓｓｏｒ?ｇｅｎｅｓ?（ＴＳＧｓ）．?（Ａ）?Ａ?ｔｏｔａｌ?ｏｆ?１８９?ｈ＼ｐｏｍｅｔｌｎ?ｌａｔｅｄ?ｕｐｒｅｇｕｌａｔｃｄ?ｇｅｎｅｓ?ｗｅｒｅ?ｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄ，??１８?ｏｆ?ｗｈｉｃｈ?ｗｅｒｅ?ｏｎｃｏｇｅｎｅｓ．?（Ｂ）?Ａ?ｔｏｔａｌ?ｏｆ?２６３?ｈ＼ｐｃｎｎｅｔ］ｎ?ｌａｔｅｄ?ｄｏｗｎｒｃｇｕｌａｔｅｄ?ｇｅｎｅｓ?ｗｅｒｅ??ｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄ．?２１?ｏｆ?ｗｈｉｃｈ?ｗｅｒｅ?ＴＳＧｓ．??１６??


本文编号：3564414