中国象鼻溞属分子生物地理学研究
发布时间：2022-01-03 15:56
象鼻溞（Bosmina）是淡水生态系统中重要的组成部分。作为一个理想的,象鼻溞已广泛应用于生态学、进化生物学、生物毒理学、群体遗传学、生物地理学以及基因组学等学科的研究中。中国在世界上具有重要的生物地理学位置,但是该区域几乎没有象鼻溞的分类学、生物地理学、进化生物学以及群体遗传学相关报道,故本论文旨在进行中国大陆象鼻溞的分子系统学鉴定以及生物地理学的初步研究,进而了解历史因子和环境因子对象鼻溞的影响。得出以下结论:1、通过测定象鼻溞核基因ITS基因序列,对中国大陆地区35个水体内的象鼻溞进行分子系统学鉴定,揭示了中国象鼻溞的地理分布概况。本次调查检测到两个主要物种:一个是东亚地区特有的B.fatalis,另一个是在全北极广泛分布的B.longirostris。除此以外,我们只在广东省的一个水库中发现了B.hagmanni.并且在青藏高原的10个水体中未发现象鼻溞的任何种类。2、进一步研究分析两个主要象鼻溞物种（即B.fatalis和B.longirostris）的16S基因碱基组成、序列变异情况、遗传多样性及遗传分化分析;并通过分子钟计算和种群历史动态分析推测地质历史事件对象鼻溞不同物...
【文章来源】：扬州大学江苏省
【文章页数】：59 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１．１研究技术路线??Ｆｉｇｕｒｅ?１．１?Ｒｅｓｅａｒｃｈ?ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ?ｒｏｕｔｅ??．．
２．３结果与分析??２．３．１?ＰＣＲ产物检测??凝胶电泳结果如图２．１所示，最右侧空白泳道为阴性对照；２６号为阳性对照，其ＤＮＡ??提取自大型潘Ｍ为Ｔｉａｎｇａｎ公司生产的Ｄ２０００Ｍａｒｋｅｒ。从图中可以看到目的??片段扩增条带清晰明亮，且无非特异性扩增条带出现。??图２．１?ＩＴＳ基因ＰＣＲ产物电泳图??Ｆｉｇｕｒｅ?２．１?Ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｇｒａｍ?ｏｆ?ＩＴＳ?ＰＣＲ?ｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ??２．３．２?ＩＴＳ单倍型检测??本章研宄的３５个群体中，在ＩＴＳ基因位点共有３０５个个体测序成功获得基因序列，??共检测到１２个单一单倍型，结果如附录三。??２．３．３?ＩＴＳ系统树的构建??基于ＩＴＳ基因的系统发生进化树显示长刺潘复合种主要有９个分支，分别对应５．??ｌｏｎｇｉｒｏｓｔｒｉｓ、Ｂ．?ｌｉｅｄｅｒｉ、Ｂ．ｆａｔａｌｉｓ、Ｂ．ｆｒｅｙｉ、Ｂ．?ｈａｇｍａｎｎｉ、Ｂ．?ｏｒｉｅｎｓ、Ｂ．?ｃｏｉ－ｅｇｏｎｉ、Ｂ．?ｌｏｎｇｉｓｐｎｉａ??和５．加７〇如／，如图２．２所示。中国３５个水体中的象鼻潘只有５．／〇叹和??５．?Ａａｇｍａｗｚ／。在系统发生进化树上，中国地区的５．?与日本以及美洲地区的象鼻??潘潘亲缘关系较近。５．没有明显的地域性分布，在泛北区各地均被发现；而５．??／ａｔｏｔｅ和５．?则有地域性分布
?１??ｏ．ｏｉ??图２．２基于ＩＴＳ基因的ＭＬ系统树??Ｆｉｇｕｒｅ?２．２?Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ?ｔｒｅｅ?ｏｆ?ＩＴＳ?ｇｅｎｅ?ｓｅｑｕｅｎｃｅ?ｕｓｉｎｇ?ＭＬ?ａｌｇｏｒｉｔｈｍ??２．３．４?ＩＴＳ单倍型网络分析??单倍型网络表明（图２．３），具有两个（／型和Ａ型）出现频率最高的单倍型。５．??为ｔｏｔｅ?（〇为?２６?个水体共有（即?ＣＡＨ，?ＤＯＨ，?ＤＴＨ，ＧＹＨ，?ＨＺＨ，?ＬＭＨ，ＰＹＨ，?ＱＤＨ，ＳＴＲ，ＴＡＨ，??ＸＬＨ，?ＸＦＪＲ，?ＹＩＨ，?ＨＬＨ，?ＨＳＨ，?ＣＧＨ，?ＥＬＳＲ，?ＳＨＨ，?ＡＨＲ，?ＣＳＨ，?ＤＩＣ，?ＦＸＨ，?ＨＦＨ，?ＨＬＴＲ，?ＳＣＲ，??ａｎｄ?ＹＣＨ），?５．?（／〇为?１７?个水体共有（即?ＣＡＨ，?ＤＰＨ，?ＬＨＲ，?ＬＵＨ，?ＰＹＨ，?ＢＳＴＨ，ＨＬＨ，??ＨＳＨ，ＫＤＬＨ，ＬＪＸＲ，ＴＩＣ，ＷＬＧＨ，ＥＬＳＲ，ＳＨＨ，ＣＳＨ，ＦＸＨ，ａｎｄ?ＹＣＨ）。其中，Ｂ．?／〇喂，＞〇对咕??（／〇为一种频繁共享的单倍型
本文编号：3566553
【文章来源】：扬州大学江苏省
【文章页数】：59 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１．１研究技术路线??Ｆｉｇｕｒｅ?１．１?Ｒｅｓｅａｒｃｈ?ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ?ｒｏｕｔｅ??．．
２．３结果与分析??２．３．１?ＰＣＲ产物检测??凝胶电泳结果如图２．１所示，最右侧空白泳道为阴性对照；２６号为阳性对照，其ＤＮＡ??提取自大型潘Ｍ为Ｔｉａｎｇａｎ公司生产的Ｄ２０００Ｍａｒｋｅｒ。从图中可以看到目的??片段扩增条带清晰明亮，且无非特异性扩增条带出现。??图２．１?ＩＴＳ基因ＰＣＲ产物电泳图??Ｆｉｇｕｒｅ?２．１?Ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｇｒａｍ?ｏｆ?ＩＴＳ?ＰＣＲ?ｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ??２．３．２?ＩＴＳ单倍型检测??本章研宄的３５个群体中，在ＩＴＳ基因位点共有３０５个个体测序成功获得基因序列，??共检测到１２个单一单倍型，结果如附录三。??２．３．３?ＩＴＳ系统树的构建??基于ＩＴＳ基因的系统发生进化树显示长刺潘复合种主要有９个分支，分别对应５．??ｌｏｎｇｉｒｏｓｔｒｉｓ、Ｂ．?ｌｉｅｄｅｒｉ、Ｂ．ｆａｔａｌｉｓ、Ｂ．ｆｒｅｙｉ、Ｂ．?ｈａｇｍａｎｎｉ、Ｂ．?ｏｒｉｅｎｓ、Ｂ．?ｃｏｉ－ｅｇｏｎｉ、Ｂ．?ｌｏｎｇｉｓｐｎｉａ??和５．加７〇如／，如图２．２所示。中国３５个水体中的象鼻潘只有５．／〇叹和??５．?Ａａｇｍａｗｚ／。在系统发生进化树上，中国地区的５．?与日本以及美洲地区的象鼻??潘潘亲缘关系较近。５．没有明显的地域性分布，在泛北区各地均被发现；而５．??／ａｔｏｔｅ和５．?则有地域性分布
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本文编号：3566553
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