染色质转座酶可及性测序研究进展

发布时间：2022-02-14 22:34

　　染色质转座酶可及性测序（assay for transposase-accessible chromatin with high-throughput sequencing,ATAC-seq）诞生于2013年,具有比脱氧核糖核酸酶I超敏感位点测序（deoxyribonuclease I hypersensitive site sequencing, DNase-seq）和微球菌核酸酶敏感位点测序（micrococcal nuclease sequencing, MNase-seq）更快速、灵敏、简便的优点,是目前分析全基因组范围染色质开放区域的热点技术。通过该技术能获得染色质开放区域的相关信息,从而映射出转录因子等调控蛋白的结合区域和核小体定位等信息,对于研究表观遗传分子机制具有重要意义。本文比较了5种获取染色质开放区域技术的优缺点,重点介绍了ATAC-seq的原理和主要流程,描述了利用ATAC-seq技术研究染色质开放区域的发展概况以及ATAC-seq的相关应用,期望对真核生物全基因组水平的染色质开放区域研究、顺式调控元件鉴定以及遗传调控网络的解析等提供借鉴。 

【文章来源】：遗传. 2020,42(04)北大核心CSCD

【文章页数】：14 页

【部分图文】：

转座及扩增过程示意图

【参考文献】：
期刊论文
[1]下一代测序技术在干细胞转录调控研究中的应用[J]. 刘亚军,张峰,刘宏德,孙啸.  遗传. 2017(08)



本文编号：3625389