优雅蝈螽肠道微生物多样性研究

发布时间：2024-07-02 19:46

　　昆虫肠道共生大量微生物,其丰富度因种类不同有较大差异。大多数昆虫的微生物定殖尚未了解,其菌群组成还有很大研究空间。优雅蝈蟲(Gampsocleis gratiosa)隶属于直翅目(Orthoptera)蟲斯科(Tettigoniidae),是研究直翅目昆虫生长发育的良好模式生物,其研究对不完全变态、也非社会性的昆虫有代表意义。主要结果如下:1、本课题基于16S rDNA V3-V4区450 bp高变序列,通过Illumina MiseqTM高通量测序,分别对优雅蝈螽两性1-7龄若虫、以及成体4个阶段,在活体状态持续收集粪便,对肠道微生物组成进行研究,每组3个生物学重复,共66个粪便样品。单个样品测序20.79-24.82万条序列,共计获得20.96 Gb原始数据。2、去除Barcode、引物和接头序列,根据Overlap关系,把成对序列拼接成一条序列。然后按照测序前的Barcode标签,分离出需要的各样本数据。并对分离得到的数据质控过滤,以去除嵌合体和非特异性扩增序列,获得最终数据。按照97%的相似性阈值,共获得576684个OTU。3、门、纲、目、科级水平,优势菌均比较单一,其他菌群...

【文章页数】：122 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图２－１?ＤＮＡ电泳图??Ｆｉｇ．２－１?Ｔｈｅ?ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ?ｏｆ?ＤＮＡ??

图２－１?ＤＮＡ电泳图??Ｆｉｇ．２－１?Ｔｈｅ?ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ?ｏｆ?ＤＮＡ??表２－４点样顺序及浓度??Ｔａｂｌｅ?２－４?Ｔｈｅ?ｓｐｏｔ?ｏｒｄｅｒ?ａｎｄ?ｃｏｎｃｅｎｔｒａｔｉｏｎ??Ｓａｍｐｌｅ—ＩＤ?ＭＮ１－Ａ?ＭＮ２－Ａ?ＭＮ３－Ａ?ＭＮ４－Ａ?....

图２－２?１６Ｓ?ｒＤＮＡ?Ｖ３－Ｖ４?ＰＣＲ产物电泳图??Ｆｉｇ．２－２?Ｔｈｅ?ＰＣＲ?ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ?ｐｒｏｄｕｃｔｓ?ｏｆ?１６Ｓ?ｒＤＮＡ?Ｖ３－Ｖ４??

表２－８第二轮反应程序??Ｔａｂｌｅ?２－８?Ｒｅａｃｔｉｏｎ?ｐｒｏｇｒａｍ?（ｓｅｃｏｎｄ?ｒｏｕｎｄ）??反应程淨?Ｗｍ?ｉｆｉ?循环数??Ｐｒｏｇｒａｍ?Ｔｅｍｐｅｒａｔｕｒｅ?Ｔｉｍｅ?Ｃｙｃｌｅｓ??预变性?９５?°Ｃ?３?ｍｉｎ?１?ｃｙｃｌｅ??９４?°Ｃ?２０?....

图２－３质控后优雅蝈螽雄性序列长度分布图??Ｆｉｇ．２－３?Ｌｅｎｇｔｈ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｒｅａｄｓ?ａｆｔｅｒ?ＱＣ?（ｍａｌｅ?

图２－３质控后优雅蝈螽雄性序列长度分布图??Ｆｉｇ．２－３?Ｌｅｎｇｔｈ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｒｅａｄｓ?ａｆｔｅｒ?ＱＣ?（ｍａｌｅ?Ｇａｍｐｓｏｃｌｅｉｓ?ｇｒａｔｉｏｓａ）??３２??

图２－４质控后优雅蝈螽雌性序列长度分布图??Ｆｉｇ．２－４?Ｌｅｎｇｔｈ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｒｅａｄｓ?ａｆｔｅｒ?ＱＣ?（ｆｅｍａｌｅ?Ｇａｍｐｓｏｃｌｅｉｓ?ｇｒａｔｉｏｓａ）??各样本的编号、分组情况、Ｂａｒｃｏｄｅ序列、原始序列数目，以及?

ＭＡ３?ＭＡ４??图２－３质控后优雅蝈螽雄性序列长度分布图??Ｆｉｇ．２－３?Ｌｅｎｇｔｈ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｒｅａｄｓ?ａｆｔｅｒ?ＱＣ?（ｍａｌｅ?Ｇａｍｐｓｏｃｌｅｉｓ?ｇｒａｔｉｏｓａ）??３２??

本文编号：3999918