樟叶越桔CYP450基因片段克隆与家族分析

发布时间：2022-02-23 02:08

　　广泛存在于生物体内的CYP450具有参与多种内源物质的新陈代谢和解除外源化学物质毒害作用的功能。本研究基于RNA-Seq数据,应用RT-PCR技术首次从樟叶越桔中克隆获得21个CYP450基因cDNA片段。应用生物信息学技术对21个樟叶越桔CYP450基因进行相似性分析、功能注释、家族分类以及聚类分析,除2个基因的家族分类不明确外,其余所有基因被分属于10个不同的CYP450家族中,分别为:CYP71、CYP72、CYP76、CYP81、CYP82、CYP86、CYP94、CYP97、CYP734和CYP735。推测有10个基因参与脂肪族、芳香族碳的羟基化,4个基因参与植物激素细胞分裂素的合成与降解,3个基因参与脂肪酸的羟基化,2个基因参与萜类化合物的合成。而KEGG分析结果显示2个基因家族未知的樟叶越桔CYP450基因可能参与了K00327途径。21个樟叶越桔CYP450基因能成功地与24个拟南芥CYP450基因聚类到一起。值得关注的是有2个樟叶越桔CYP450基因CL75.Contig1₂A（9）和Unigene22570₂A（14）被归... 

【文章来源】：分子植物育种. 2020,18(02)北大核心CSCD

【文章页数】：11 页

【文章目录】：
1 结果与分析
    1.1 总RNA提取
    1.2 樟叶越桔CYP450基因与引物设计
    1.3 樟叶越桔CYP450基因克隆
    1.4 序列同源性比对与分析
    1.5 樟叶越桔CYP450基因功能注释与家族分类
    1.6 樟叶越桔CYP450家族聚类分析
2 讨论
3 材料与方法
    3.1 实验材料
    3.2 总RNA提取
    3.3 樟叶越桔CYP450基因挖掘与引物设计
    3.4 樟叶越桔CYP450基因克隆
    3.5 序列分析与家族聚类
作者贡献


【参考文献】：
期刊论文
[1]青海湖裸鲤CYP17a2基因的克隆及表达分析[J]. 张霞,卫福磊,张娅,卫唯,朱福祥,王玉晴,栗瑞红,韩步鹰,刘小红,千康康,吴君,朱世海,李长忠.  基因组学与应用生物学. 2018(05)
[2]刺五加P450基因时空表达差异及与皂苷含量的相关性分析[J]. 吴鹏,谷俊涛,修乐山,邢朝斌.  河北农业大学学报. 2014(03)
[3]家蚕细胞色素P450基因的研究进展[J]. 艾均文,薛宏,何行健,孟繁利,朱勇,向仲怀.  昆虫学报. 2011(08)
[4]甜菊醇糖苷生物合成途径关键酶基因KA13H的克隆及序列分析[J]. 郭书巧,束红梅,郑卿,倪万潮.  基因组学与应用生物学. 2010(05)
[5]植物细胞色素P450基因与功能研究进展[J]. 贺丽虹,赵淑娟,胡之璧.  药物生物技术. 2008(02)
[6]细胞色素P450基因及其在植物改良中的应用[J]. 杨致荣,毛雪,杨致芬,李润植.  遗传. 2003(02)



本文编号：3640652