中国腹露蝗属物种定界及分子鉴定研究

发布时间：2022-10-29 20:28

　　腹露蝗属Fruhstorferiola Willemse,1922隶属于直翅目Orthoptera,蝗总科Acridoidea,斑腿蝗科Catantopidae,黑蝗亚科Melanoplinae。为丰富腹露蝗属分子系统学数据,探讨腹露蝗属单系性和属内部分形态学物种的独立性,本研究采用高通量测序结合克隆测序的方法,获得了 7种腹露蝗属蝗虫共72条线粒体全基因组数据并分析了腹露蝗属线粒体全基因组特征。结合从GenBank上下载的20种相关蝗总科昆虫全线粒体数据和实验室积累腹露蝗属COXI基因数据,采用多种方法进行了腹露蝗属的系统发育关系研究、物种定界研究和条形码分子鉴定成功率检测。主要结果如下:1.七种腹露蝗线粒体基因组表征七种腹露蝗线粒体全基因组全长在15679bp～15727bp之间,基因组成与亚库巴果蝇一致,基因排列顺序与亚库巴果蝇相比trnK与trnD基因发生易位;线粒体全基因组全长A+T碱基含量超过75%,表现出明显的AT偏向;13个蛋白质编码基因起始密码子均为ATN标准密码子,终止密码子除COI基因（终止密码子为不完整的T）外均为完整的TAA或TAG。21个tRNA二级结构为标... 

【文章页数】：125 页

【学位级别】：硕士

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摘要
ABSTRACT
1 引言
    1.1 腹露蝗属研究概况
        1.1.1 腹露蝗属分类学研究进展
        1.1.2 腹露蝗属其他方面研究进展
    1.2 昆虫线粒体基因组及分子鉴定研究进展
        1.2.1 昆虫线粒体基因组研究进展
        1.2.2 昆虫分子鉴定研究进展
    1.3 研究的目的及意义
2 实验材料与研究方法
    2.1 实验材料
    2.2 测序方法
        2.2.1 高通量测序
        2.2.2 克隆测序
    2.3 线粒体基因组组装与注释
        2.3.1 线粒体基因组组装
        2.3.2 线粒体基因组注释
    2.4 分子系统学研究方法
        2.4.1 系统发育研究方法
        2.4.2 物种定界研究方法
        2.4.3 分子鉴定成功率检测方法
3 腹露蝗属昆虫线粒体全基因组基本特征
    3.1 基本结构
    3.2 核苷酸组成分析
    3.3 蛋白质编码基因分析
    3.4 转运RNA与核糖体RNA分析
    3.5 A+T富集区分析
4 腹露蝗属分子系统学研究
    4.1 系统发育研究
        4.1.1 数据集相关分析
        4.1.2 系统发育分析
    4.2 物种定界研究
        4.2.1 数据集相关分析
        4.2.2 物种定界NJ聚类分析
        4.2.3 遗传距离
        4.2.4 单倍型网络图
    4.3 分子鉴定成功率检测
5 结论与展望
    5.1 七种腹露蝗线粒体全基因组特征
    5.2 系统发育
    5.3 物种定界
    5.4 分子鉴定
    5.5 创新点和展望
参考文献
附录A: 7种腹露蝗线粒体全基因组组成
附录B: 7腹露蝗线粒体全基因组碱基组成
附录C: 7种腹露蝗线粒体全基因组蛋白质编码基因密码子使用频率
附录D: 7种腹露蝗线粒体全基因组TRNA二级结构预测图
附录E: 不同线粒体单基因遗传距离
附录F: 基于不同单基因数据集所得单倍型网络图
附录G 攻读硕士学位期间的主要学术成果
    附录G1: 科研项目
    附录G2: 发表论文
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]DNA条形码技术在昆虫分类学中的研究进展[J]. 魏明峰,张振旺.  农学学报. 2019(04)
[2]蚜蝇科昆虫比较线粒体基因组分析[J]. 李娟,李虎,霍科科.  陕西理工大学学报(自然科学版). 2019(01)
[3]直翅目昆虫线粒体基因组特征及系统发育研究[J]. 赵乐,李雪娟,黄原.  生命科学. 2018(01)
[4]无齿稻蝗和黄翅踵蝗线粒体基因组与系统发育分析[J]. 常会会,杨丽平,刘菲,汪晓阳,邱忠营,李雪娟,黄原.  基因组学与应用生物学. 2018(01)
[5]白洋淀湿地蝗虫多样性调查及DNA条形码应用研究[J]. 郝金凤,张晓红,王昱淞,刘金林,智永超,李新江.  生物多样性. 2017(04)
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[8]中国历史蝗灾动态的社会影响及生态环境意义[J]. 李钢,王乃昂,李卓仑.  地理科学进展. 2010(11)
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[10]越北腹露蝗虫害发生程度分阶段动态预报[J]. 杨永生,蒋国华,宋艳华,涂宏兰,彭惠英.  广东农业科学. 2010(08)

博士论文
[1]基于高通量测序的雏蝗属线粒体基因组测定及分子系统学研究[D]. 董佳佳.陕西师范大学 2018
[2]直翅目昆虫线粒体基因组比较、谱系及进化研究[D]. 邱忠营.陕西师范大学 2016
[3]直翅目部分物种的DNA条形编码与谱系芯片研究[D]. 毛少利.陕西师范大学 2011

硕士论文
[1]基于线粒体基因组的中国黑蝗亚科系统发育研究[D]. 姜兵.中南林业科技大学 2019
[2]腹露蝗属的订正、系统发育及生物地理学研究[D]. 杨瑞.陕西师范大学 2015
[3]广西弄岗自然保护区直翅目昆虫区系及部分物种的DNA条形编码研究[D]. 韦滔.广西师范大学 2014
[4]基于COⅡ＆18S rDNA基因序列的蝗总科部分种类的分子系统学研究[D]. 魏秀娟.陕西师范大学 2011
[5]基于线粒体cytb基因序列的金线蛙分子系统地理学[D]. 刘奎.首都师范大学 2009



本文编号：3698368