菰核基因组SSR引物的开发及其在稻族植物中的通用性检测（英文）

发布时间：2023-04-27 22:53

　　利用数据库中已有的部分菰(Zizania latifolia Turcz.)核基因组序列,采用in silico方法开发其SSR引物,并选取我国不同纬度的5个菰野生种群,对合成的64对引物进行筛选。结果显示:64对引物中有15对至少在一个种群中表现出多态性;共发现84个等位基因,每个位点平均有5.6个等位基因。在5个种群中,观察杂合度为0.000～0.941,预期杂合度为0.072～0.625。种群间的基因流(N_m=0. 576)水平较低导致了种群间表现出较高的遗传分化(F_ST=0. 432)。进一步对稻族其他物种的通用性检测发现,15个多态位点中,有8个位点在亚洲栽培稻(Oryza sativa L.)中得到扩增,有9个位点在普通野生稻(O. rufipogon Griff.)中得到扩增。

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【文章目录】：
1 Materials and Methods
    1.1 SSR identification and primer design
    1.2 SSR validation and cross-transferability test
    1.3 Data analysis
2 Results
3 Discussion



本文编号：3803226