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甘蓝型油菜苗期干旱及旱后复水相关性状的全基因组关联分析

发布时间:2023-05-03 20:59
  油菜是世界范围内广泛种植的重要油料作物,也是我国食用植物油的来源之一。干旱是全球范围内危害农业生产的主要非生物逆境之一,严重影响油菜的正常生长发育及产量和品质。近年来,前人在甘蓝型油菜的抗旱机理方面已做了许多研究,然而在半干旱地区,油菜生长发育的水分环境具有干旱与湿润交替进行的特点。因此,研究甘蓝型油菜在干旱及旱后复水条件下的生长状况,以模拟半干旱地区油菜生长的水分特点,对研究甘蓝型油菜对干旱胁迫的适应能力,包括耐旱性及旱后复水的综合抗旱能力,具有重要意义。本研究以120份来自国内外的甘蓝型油菜品种(系)为试验材料,测定了干旱与正常灌溉、旱后复水与正常灌溉的叶片保水力、叶片相对含水量、地上部鲜重、地上部干重、地下部鲜重、地下部干重和丙二醛含量等性状。结合油菜60K Illumina Infinium SNP芯片筛选出32329个有效SNP位点,分析了试验材料的群体结构、亲缘关系和连锁不平衡衰减特性,并基于na?ve,Q,PCA,K,K+Q,K+PCA等6种模型对干旱胁迫期间的耐旱系数和旱后复水的综合抗旱能力进行全基因组关联分析。最后利用检测出的显著关联SNP位点所在候选区间及同源拟南芥...

【文章页数】:80 页

【学位级别】:硕士

【文章目录】:
摘要
Abstract
第1章 文献综述
    1.1 作物对干旱胁迫的响应
    1.2 作物的耐旱机制
        1.2.1 作物根系的耐旱机制
        1.2.2 渗透调节作用的耐旱机制
        1.2.3 抗氧化防御系统的耐旱机制
        1.2.4 其他耐旱机制
    1.3 作物对旱后复水的响应
    1.4 油菜对干旱的响应
    1.5 关联分析
        1.5.1 关联分析的原理和特点
        1.5.2 关联分析的途径和步骤
        1.5.3 关联分析在油菜非生物胁迫中的应用
    1.6 研究目的和意义
    1.7 技术路线
第2章 材料与方法
    2.1 试验设计
    2.2 性状调查
        2.2.1 地上部鲜重和干重、地下部鲜重和干重的测定
        2.2.2 叶片保水力的测定
        2.2.3 叶片相对含水量的测定
        2.2.4 丙二醛含量的测定
    2.3 表型数据处理
    2.4 SNP标记分析
    2.5 群体结构分析
    2.6 亲缘关系分析
    2.7 连锁不平衡分析
    2.8 关联分析
    2.9 候选基因预测
第3章 结果与分析
    3.1 表型数据分析
    3.2 SNP标记分析
    3.3 群体结构分析
    3.4 亲缘关系分析
    3.5 连锁不平衡分析
    3.6 全基因组关联分析
    3.7 候选基因预测
第4章 讨论
    4.1 干旱对油菜苗期生长的影响
    4.2 旱后复水对油菜苗期生长的影响
    4.3 关联分析与候选基因分析
第5章 结论
参考文献
附录 120份甘蓝型油菜品种(系)信息
主要缩略语
致谢
发表论文及参加课题一览表



本文编号:3807272

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