家鼠的核糖体蛋白基因中内含子序列间成环匹配特征分析

发布时间：2024-01-19 15:53

　　随着全基因组测序技术的进步,目前己获得了大量的序列信息。基因组序列的绝大部分是非编码序列,极少部分是编码序列,而这些非编码序列的生物学信息和功能已经受到越来越多研究者们的关注。不少研究结果显示这些非编码序列可能在生命活动中起着非常重要的作用。内含子作为断裂基因的非编码序列,它的生物学意义和功能已成为生物学热点课题。相关研究表明,环状RNA在基因的表达及一些疾病的起源中起着非常重要的作用,而部分环状RNA(circular RNA,circRNA)的形成与内含子之间的成环匹配息息相关。我们选取了家鼠基因组中核糖体蛋白基因序列作为研究对象,采用Smith-Waterman局域比对法研究了内含子序列之间的成环匹配特征,具体研究内容如下:1.选取家鼠基因组中核糖体蛋白基因序列作为研究对象,提取了所有核蛋白基因序列,对于每一条基因序列,按照内含子序列位置的不同,分别整理出第一内含子、第二内含子……等不同位置内含子组。以此为基础,统计了每一组内含子序列的长度、GC含量分布等特征,结果表明,家鼠核糖体蛋白基因中,多数内含子序列长度集中在98bp和1200bp左右,多数内含子的GC含量处于43%

【文章页数】：60 页

【学位级别】：硕士

本文编号：3880078