国槐遗传多样性评价及无性系分子鉴别
发布时间：2022-12-04 15:56
国槐（Sophora japonica Linn.）为我国重要的药用植物资源,其根、枝、皮、叶、花、果中均含有黄酮类（flavonoids）成分,几乎全株入药。其中《中国药典》规定的中药槐米含有质芦丁（rutin,约13%~28%）、槲皮素（quercetin）、山柰酚（kaempferol）及其糖苷等成分;槐角中除含有上述成分外,还含有异黄酮类（isoflavones）物质等。国槐入药部位功能与成分不仅具有清热泻火、止血、降血压、抗氧化、延缓衰老、抗炎、镇痛、抗骨质疏松、抗肿瘤、明目益气等药理作用,还是重要的观赏树种及蜜源树种,在药用种质收集与挖掘、现代林业与景观生态的发展等方面具有极为巨大的应用前景。但是其种质资源研究技术缺失、精准鉴定和系统评价不足。本论文旨在开发g SSR、EST-SSR和cp SSR标记的基础上,建立了国槐无性系分子鉴别技术及分子身份证数据库;对国槐古树及栽培群体进行STRUCTURE群体分析、分子方差分析、聚类分析与亲缘关系分析。研究表明,国槐古树及现代栽培群体的种质资源遗传多样性水平相对较高。基于等位基因位点数目最大化策略筛选了186个无性系,可作为将来构...
【文章页数】：294 页
【学位级别】：博士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 绪论
1.1 引言
1.1.1 研究背景
1.1.2 研究目的和意义
1.1.3 项目来源与经费支持
1.2 植物种质资源鉴别及其遗传多样性研究进展
1.2.1 种质资源鉴别研究进展
1.2.2 遗传多样性研究进展
1.2.3 核心种质构建研究进展
1.3 国槐无性系鉴别及其遗传多样性研究进展
1.3.1 国槐的化石记录
1.3.2 国槐及其种下单元的分类地位
1.3.3 国槐SSR标记开发研究进展
1.3.4 国槐无性系鉴别研究进展
1.3.5 国槐遗传多样性研究进展
1.3.6 国槐核心种质研究进展
1.4 主要研究内容和研究目标
1.4.1 研究目标
1.4.2 研究内容
1.5 研究技术路线
第二章 国槐SSR分子标记开发及其多态性验证
2.1 材料与方法
2.1.1 试验材料
2.1.2 主要试验仪器
2.1.3 试验方法
2.1.4 国槐SSR引物设计方法
2.1.5 不同类型国槐SSR引物筛选方法
2.1.6 不同类型国槐SSR引物多态性验证及有效性评价方法
2.1.7 数据统计分析方法
2.2 结果与分析
2.2.1 国槐gSSR特征及其引物开发
2.2.2 国槐叶片转录组测序及EST-SSR引物开发
2.2.3 基于堇花槐叶绿体基因组测序的cpSSR引物开发
2.2.4 不同类型国槐SSR引物设计
2.2.5 国槐gSSR、EST-SSR和 cpSSR引物筛选
2.2.6 国槐gSSR、EST-SSR和 cpSSR引物多态性验证
2.2.7 国槐gSSR、EST-SSR和 cpSSR引物及其组合有效性评价
2.3 讨论
2.3.1 gSSR、EST-SSR和 cpSSR引物的开发与验证
2.3.2 gSSR、EST-SSR和 cpSSR引物的有效性评价及筛选
2.3.3 gSSR、EST-SSR和 cpSSR引物的通用性
2.3.4 堇花槐的系统发育位置
2.4 小结
第三章 国槐无性系鉴别及分子身份证构建
3.1 材料与方法
3.1.1 试验材料
3.1.2 试验方法
3.2 结果与分析
3.2.1 国槐gSSR、EST-SSR和 cpSSR引物等位基因分析
3.2.2 国槐无性系鉴别分析
3.2.3 国槐无性系分子身份证研建
3.2.4 基于二维码技术的国槐无性系分子身份证构建
3.3 讨论
3.3.1 国槐指纹图谱与分子身份证
3.3.2 基于SSR标记研制国槐分子身份证可行性及稳定性
3.3.3 作物分子身份证构建软件的适用性
3.3.4 分子身份证编制规则
3.3.5 分子身份证的应用
3.4 小结
第四章 国槐遗传多样性及其核心种质分析
4.1 材料与方法
4.1.1 试验材料采集范围的确定
4.1.2 试验方法
4.1.3 数据分析方法
4.2 结果与分析
4.2.1 国槐不同区域栽培群体遗传多样性分析
4.2.2 国槐不同类别群体亲缘关系分析
4.2.3 基于SSR标记构建国槐核心种质
4.2.4 国槐186份核心种质的来源、亲缘关系及其分子身份证
4.3 讨论
4.3.1 国槐现代栽培遗传多样中心
4.3.2 核心种质的构建方法
4.3.3 亚群体的个体组成及其特征
4.3.4 国槐种质资源保护与利用策略
4.4 小结
第五章 结论与讨论
5.1 结论
5.2 讨论
5.3 展望
5.4 创新点
参考文献
附录
在读期间的学术研究
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于AFLP遗传多样性和叶片内含物的银杏特异种质资源分析[J]. 胡亚平,曹福亮,汪贵斌,郭起荣. 分子植物育种. 2020(02)
[2]基于SLAF-seq技术的古茶树SNP位点开发[J]. 耿广东,陈立杰,张素勤. 经济林研究. 2019(02)
[3]利用ISSR构建甜菜品种指纹图谱[J]. 齐少玮,闫彩燕,郭佳,吴则东,兴旺. 中国糖料. 2019(04)
[4]基于三角梅转录组测序的SSR分子标记的开发[J]. 赵彤,常圣鑫,冷青云,徐世松,尹俊梅,牛俊海. 分子植物育种. 2019(13)
[5]生化和ISSR分子标记在黑木耳品种鉴定中的应用[J]. 史灵燕,刘保卫,顾新颖,郭金英,郑素月,张庆桥. 北方园艺. 2019(09)
[6]广西地方葛根种质资源遗传多样性的SCoT分析[J]. 尚小红,严华兵,曹升,肖亮,王艳,欧昆鹏. 核农学报. 2019(07)
[7]正交法比较三种常见的槐米总黄酮提取工艺[J]. 肖梦媛,肖莲,文艳霞. 广州化工. 2019(09)
[8]基于CAPS标记的甜瓜单果重相关性状QTL分析[J]. 刘相玉,张裕舒,刘柳,刘识,高鹏,王迪,王学征. 中国农业科学. 2019(09)
[9]基于SRAP分子标记的材用云南松种质保存库构建策略[J]. 王晓丽,高成杰,李昆. 植物科学学报. 2019(02)
[10]基于ISSR分子标记的石楠属植物遗传多样性分析[J]. 蒋笑丽,章建红,李玉祥,王正加. 浙江农业科学. 2019(04)
博士论文
[1]槐角和莲子心化学成分及生物活性的研究[D]. 张庆贺.吉林大学 2018
[2]灰木莲种质资源遗传多样性研究[D]. 文珊娜.中国林业科学研究院 2017
[3]桉树种质资源遗传多样性分析及精准鉴定体系的初步研究[D]. 刘果.中国林业科学研究院 2017
[4]锦葵科椴树属（Tilia L.）的叶绿体系统发育基因组学研究[D]. 蔡杰.云南大学 2016
[5]新疆杏种质资源遗传多样性及核心种质构建[D]. 刘娟.新疆农业大学 2015
[6]苏皖4种同域分布栎树的遗传变异与基因渐渗[D]. 魏高明.南京林业大学 2015
[7]柴松分类地位与遗传多样性研究[D]. 解庆.西北农林科技大学 2015
[8]金槐槐米品质及规范化种植关键技术研究[D]. 谢锋.成都中医药大学 2014
[9]槐角异黄酮生物转化及其产物抗乳腺癌细胞活性研究[D]. 邬建国.华中科技大学 2011
[10]毛竹SSR位点引物开发及部分竹种系统学分析[D]. 刘贯水.中国林业科学研究院 2010
硕士论文
[1]基于叶绿体DNA片段和核微卫星标记的槲树群体历史和遗传多样性研究[D]. 李慧敏.西北大学 2018
[2]白栎的群体遗传结构和谱系地理学研究[D]. 陈晓丹.西北大学 2018
[3]用农艺性状和分子标记评估引入小麦资源的遗传多样性[D]. 王丹.西北农林科技大学 2018
[4]中国栎属麻栎组三个近缘物种的群体遗传学和种群动态历史研究[D]. 张昊.西北大学 2018
[5]槐属观赏乔木国槐、龙爪槐、金枝国槐和红花国槐抗旱性抗寒性生理研究[D]. 王纬航.内蒙古农业大学 2017
[6]广东桑和鲁桑叶绿体基因组高通量测序及基因注释分析[D]. 李巧丽.西北农林科技大学 2017
[7]基于cpDNA和SSR标记的槲栎群体遗传学研究[D]. 邸晓瑶.西北大学 2017
[8]湿地松EST-SSR引物开发及其亲缘关系的研究[D]. 赵衡.江西农业大学 2016
[9]华山松及其近缘种的群体遗传学和物种形成研究[D]. 祝娟.西北大学 2016
[10]苦荞种质遗传资源农艺性状的评价及SSR指纹图谱的构建[D]. 潘凡.贵州师范大学 2016
本文编号：3708561
【文章页数】：294 页
【学位级别】：博士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 绪论
1.1 引言
1.1.1 研究背景
1.1.2 研究目的和意义
1.1.3 项目来源与经费支持
1.2 植物种质资源鉴别及其遗传多样性研究进展
1.2.1 种质资源鉴别研究进展
1.2.2 遗传多样性研究进展
1.2.3 核心种质构建研究进展
1.3 国槐无性系鉴别及其遗传多样性研究进展
1.3.1 国槐的化石记录
1.3.2 国槐及其种下单元的分类地位
1.3.3 国槐SSR标记开发研究进展
1.3.4 国槐无性系鉴别研究进展
1.3.5 国槐遗传多样性研究进展
1.3.6 国槐核心种质研究进展
1.4 主要研究内容和研究目标
1.4.1 研究目标
1.4.2 研究内容
1.5 研究技术路线
第二章 国槐SSR分子标记开发及其多态性验证
2.1 材料与方法
2.1.1 试验材料
2.1.2 主要试验仪器
2.1.3 试验方法
2.1.4 国槐SSR引物设计方法
2.1.5 不同类型国槐SSR引物筛选方法
2.1.6 不同类型国槐SSR引物多态性验证及有效性评价方法
2.1.7 数据统计分析方法
2.2 结果与分析
2.2.1 国槐gSSR特征及其引物开发
2.2.2 国槐叶片转录组测序及EST-SSR引物开发
2.2.3 基于堇花槐叶绿体基因组测序的cpSSR引物开发
2.2.4 不同类型国槐SSR引物设计
2.2.5 国槐gSSR、EST-SSR和 cpSSR引物筛选
2.2.6 国槐gSSR、EST-SSR和 cpSSR引物多态性验证
2.2.7 国槐gSSR、EST-SSR和 cpSSR引物及其组合有效性评价
2.3 讨论
2.3.1 gSSR、EST-SSR和 cpSSR引物的开发与验证
2.3.2 gSSR、EST-SSR和 cpSSR引物的有效性评价及筛选
2.3.3 gSSR、EST-SSR和 cpSSR引物的通用性
2.3.4 堇花槐的系统发育位置
2.4 小结
第三章 国槐无性系鉴别及分子身份证构建
3.1 材料与方法
3.1.1 试验材料
3.1.2 试验方法
3.2 结果与分析
3.2.1 国槐gSSR、EST-SSR和 cpSSR引物等位基因分析
3.2.2 国槐无性系鉴别分析
3.2.3 国槐无性系分子身份证研建
3.2.4 基于二维码技术的国槐无性系分子身份证构建
3.3 讨论
3.3.1 国槐指纹图谱与分子身份证
3.3.2 基于SSR标记研制国槐分子身份证可行性及稳定性
3.3.3 作物分子身份证构建软件的适用性
3.3.4 分子身份证编制规则
3.3.5 分子身份证的应用
3.4 小结
第四章 国槐遗传多样性及其核心种质分析
4.1 材料与方法
4.1.1 试验材料采集范围的确定
4.1.2 试验方法
4.1.3 数据分析方法
4.2 结果与分析
4.2.1 国槐不同区域栽培群体遗传多样性分析
4.2.2 国槐不同类别群体亲缘关系分析
4.2.3 基于SSR标记构建国槐核心种质
4.2.4 国槐186份核心种质的来源、亲缘关系及其分子身份证
4.3 讨论
4.3.1 国槐现代栽培遗传多样中心
4.3.2 核心种质的构建方法
4.3.3 亚群体的个体组成及其特征
4.3.4 国槐种质资源保护与利用策略
4.4 小结
第五章 结论与讨论
5.1 结论
5.2 讨论
5.3 展望
5.4 创新点
参考文献
附录
在读期间的学术研究
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于AFLP遗传多样性和叶片内含物的银杏特异种质资源分析[J]. 胡亚平,曹福亮,汪贵斌,郭起荣. 分子植物育种. 2020(02)
[2]基于SLAF-seq技术的古茶树SNP位点开发[J]. 耿广东,陈立杰,张素勤. 经济林研究. 2019(02)
[3]利用ISSR构建甜菜品种指纹图谱[J]. 齐少玮,闫彩燕,郭佳,吴则东,兴旺. 中国糖料. 2019(04)
[4]基于三角梅转录组测序的SSR分子标记的开发[J]. 赵彤,常圣鑫,冷青云,徐世松,尹俊梅,牛俊海. 分子植物育种. 2019(13)
[5]生化和ISSR分子标记在黑木耳品种鉴定中的应用[J]. 史灵燕,刘保卫,顾新颖,郭金英,郑素月,张庆桥. 北方园艺. 2019(09)
[6]广西地方葛根种质资源遗传多样性的SCoT分析[J]. 尚小红,严华兵,曹升,肖亮,王艳,欧昆鹏. 核农学报. 2019(07)
[7]正交法比较三种常见的槐米总黄酮提取工艺[J]. 肖梦媛,肖莲,文艳霞. 广州化工. 2019(09)
[8]基于CAPS标记的甜瓜单果重相关性状QTL分析[J]. 刘相玉,张裕舒,刘柳,刘识,高鹏,王迪,王学征. 中国农业科学. 2019(09)
[9]基于SRAP分子标记的材用云南松种质保存库构建策略[J]. 王晓丽,高成杰,李昆. 植物科学学报. 2019(02)
[10]基于ISSR分子标记的石楠属植物遗传多样性分析[J]. 蒋笑丽,章建红,李玉祥,王正加. 浙江农业科学. 2019(04)
博士论文
[1]槐角和莲子心化学成分及生物活性的研究[D]. 张庆贺.吉林大学 2018
[2]灰木莲种质资源遗传多样性研究[D]. 文珊娜.中国林业科学研究院 2017
[3]桉树种质资源遗传多样性分析及精准鉴定体系的初步研究[D]. 刘果.中国林业科学研究院 2017
[4]锦葵科椴树属（Tilia L.）的叶绿体系统发育基因组学研究[D]. 蔡杰.云南大学 2016
[5]新疆杏种质资源遗传多样性及核心种质构建[D]. 刘娟.新疆农业大学 2015
[6]苏皖4种同域分布栎树的遗传变异与基因渐渗[D]. 魏高明.南京林业大学 2015
[7]柴松分类地位与遗传多样性研究[D]. 解庆.西北农林科技大学 2015
[8]金槐槐米品质及规范化种植关键技术研究[D]. 谢锋.成都中医药大学 2014
[9]槐角异黄酮生物转化及其产物抗乳腺癌细胞活性研究[D]. 邬建国.华中科技大学 2011
[10]毛竹SSR位点引物开发及部分竹种系统学分析[D]. 刘贯水.中国林业科学研究院 2010
硕士论文
[1]基于叶绿体DNA片段和核微卫星标记的槲树群体历史和遗传多样性研究[D]. 李慧敏.西北大学 2018
[2]白栎的群体遗传结构和谱系地理学研究[D]. 陈晓丹.西北大学 2018
[3]用农艺性状和分子标记评估引入小麦资源的遗传多样性[D]. 王丹.西北农林科技大学 2018
[4]中国栎属麻栎组三个近缘物种的群体遗传学和种群动态历史研究[D]. 张昊.西北大学 2018
[5]槐属观赏乔木国槐、龙爪槐、金枝国槐和红花国槐抗旱性抗寒性生理研究[D]. 王纬航.内蒙古农业大学 2017
[6]广东桑和鲁桑叶绿体基因组高通量测序及基因注释分析[D]. 李巧丽.西北农林科技大学 2017
[7]基于cpDNA和SSR标记的槲栎群体遗传学研究[D]. 邸晓瑶.西北大学 2017
[8]湿地松EST-SSR引物开发及其亲缘关系的研究[D]. 赵衡.江西农业大学 2016
[9]华山松及其近缘种的群体遗传学和物种形成研究[D]. 祝娟.西北大学 2016
[10]苦荞种质遗传资源农艺性状的评价及SSR指纹图谱的构建[D]. 潘凡.贵州师范大学 2016
本文编号：3708561
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