汉族散发性帕金森病候选风险基因位点的遗传多态性研究

发布时间：2023-12-26 20:08

　　目的:利用MassARRAY质谱测序方法在中国汉族人群中分析散发性帕金森病(SPD)相关易感基因的多态性,为早期识别易感者及进一步探讨发病机制与治疗的研究提供依据。方法:收集南昌大学第一附属医院和南方医科大学附属广东总医院共398例中国汉族SPD,和430例正常对照组的临床资料及外周静脉血,分别提取DNA并行质量检测,结合前期研究及其他相关文献,选择30个SPD最可能相关的候选SNPs,利用质谱MassARRAY平台检测和DNA测序技术进行测序并对其基因型的差异性进行分析,并一步对其可能的生物学功能进行预测。结果:(1)通过质谱分析及一代测序确认rs863108、rs80315856、rs28499371和rs2270568多态性与汉族血统SPD的发病机制有关。(2)rs863108的T等位基因为SPD的保护性等位基因,其A/T基因型降低了SPD的患病风险;rs80315856的T等位基因是SPD的危险位点,其G/T基因型是增加患SPD的风险;rs28499371的T等位基因为SPD的保护性等位基因,其C/T基因型降低患SPD的风险;rs2270568的T/T基因型增加SPD的风险。(...

【文章页数】：88 页

【学位级别】：博士

【文章目录】：
摘要
abstract
符号说明
第1章 引言
    1.1 帕金森病概述
    1.2 帕金森病临床表现
    1.3 帕金森病发病机制
        1.3.1 DA及性激素与PD相关
        1.3.2 异常铁沉积与PD发病相关:
        1.3.3 神经营养因子、线粒体功能与PD发病相关:
    1.4 帕金森病目前诊断研究热点
        1.4.1 帕金森病目前生物标志物研究热点
        1.4.2 帕金森病目前影像诊断研究热点
        1.4.3 帕金森病目前基因诊断研究热点
    1.5 帕金森病治疗的发展
        1.5.1 帕金森病的传统治疗
        1.5.2 帕金森病的基因治疗
    1.6 帕金森病遗传生物学研究进展
第2章 材料与方法
    2.1 临床实验对象来源及分组收集
    2.2 单核苷酸(SNPs)的选择
        2.2.1 功能区域SNP的筛选
        2.2.2 有效或热点SNP的筛选
        2.2.3 对候选SNP进一步优化
    2.3 主要仪器设备与试剂
        2.3.1 主要试剂
        2.3.2 主要实验设备和仪器
        2.3.3 主要使用的数据库及软件
    2.4 DNA的提取
    2.5 Massarray SNP分型实验流程
        2.5.1 引物设计及合成
        2.5.2 引物稀释及注意事项
        2.5.3 PCR扩增反应
        2.5.4 产物碱性磷酸酶处理
        2.5.5 单碱基延伸反应
        2.5.6 树脂纯化
        2.5.7 芯片点样
        2.5.8 质谱检测及数据输出
        2.5.9 利用Sequenom平台分析单核苷酸的基因分型
    2.6 DNA Sanger测序
    2.7 rs863108,rs28499371,rs2270568 and rs80315856 的功能预测
        2.7.1 rs80315856
        2.7.2 rs863108 内含子突变点研究方法
        2.7.3 rs28499371 错义突变点分析研究方法
        2.7.4 rs2270568 同义突变点分析研究方法
    2.8 临床资料统计学处理
第3章 结果
    3.1 运用质谱MassARRAY平台检测技术分析30 个单核苷酸与sPD之 间的基因关联
    3.2 运用DNASanger一代测序技术确认质谱MassARRAY平台检测的结论
    3.3 rs863108,rs28499371 and rs2270568 的功能预测
        3.3.1 rs863108 的一般突变信息,核受体结合位点预测和转录因子结合位点预测
        3.3.2 rs28499371 的一般突变信息、致病性预测、结构域分析、蛋白家族进化分析和结构建模分析
        3.3.3 rs2270568 突变的一般信息、致病性预测及结构建模
第4章 讨论
    4.1 rs863108与SPD的关系
    4.2 rs80315856与SPD的关系
    4.3 rs28499371与SPD的关系
    4.4 rs2270568与SPD的关系
第5章 总结
    5.1 结论
    5.2 本研究的不足之处及远景展望
致谢
参考文献
附表
攻读学位期间的研究成果
综述
    参考文献



本文编号：3875476