基于COI基因的橡胶树六点始叶螨遗传多样性分析

发布时间：2024-02-24 19:09

　　六点始叶螨是橡胶树上的重要害螨之一,具有分布范围广、危害重等特点。为了研究其遗传多样性和遗传分化,本研究利用线粒体COI(mitochondrial cytochrome oxidase subunit I)基因序列对采自海南、云南、越南河内等地区橡胶树上的11个不同地理种群的165头样本进行了种群的遗传多样性分析。获得的六点始叶螨线粒体COI基因片段长度均为658bp,分析发现可变位点30个,其中简约信息点15个,单变异位点15个,单倍型15种;种群间FST值为0.34698,Nm值为0.47,GST值为0.19660,表明11个种群的六点始叶螨存在一定的遗传分化。

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【部分图文】：

图19个六点始叶螨地理种群PCR扩增条带

通过软件分析得到，序列中不变位点628个，可变位点（variablesites)30个，占总分析位点4.56%；其中单变异位点（2个变体）[singletonvariablesites(twovariants)]15个，占总位点数的2.28%，位点分别是25、43、147....

图2可变位点位置分布图

图19个六点始叶螨地理种群PCR扩增条带2.2单倍型、核酸多样性及中性检验

图3六点始叶螨单倍型系统发育树

不同地区间地理种群见表3。各地区间的遗传分化指数FST值在-0.01974～0.75000之间，其中云南瑞丽和海南琼中与其他的地理种群差异性最大，河口和其他地理种群差异性比较小。GST值在-0.03317～1.00000之间。图4六点始叶螨不同地理种群mtDNACOI单倍型中....

图4六点始叶螨不同地理种群mtDNACOI单倍型中介网络图

图3六点始叶螨单倍型系统发育树3讨论

本文编号：3909485