不同鼠种的肠道菌群在不同饮食结构干预中的组成改变

发布时间：2021-05-09 16:02

　　目的：采取454高通量测序方法对不同饮食结构喂养的不同鼠种肠道菌群进行分析,观察并阐明不同的饮食结构下肠道多样性及群落结构的组成差异,同时进一步比较饮食对肠道菌群的影响在不同鼠种之间是否存在种属差异,为研究不同人种在同种饮食结构下在肥胖、炎症性肠病等的发病风险上仍存在差异的原因提供线索。方法：选取仍处于肠道菌群建立阶段的刚断乳Bal20b/c小鼠及SD大鼠作为研究载体,采取为期2个月的五种特制的不同结构饮食干预方法,收集各个饮食组新鲜粪便样品,提取粪便细菌总基因组DNA,对细菌16SrRNA基因序列V1-V3高变区进行PCR扩增。电泳检测PCR产物并切胶回收纯化。定量检测PCR产物,按照每个样品的测序量要求,进行相应比例的混合。寄往中国上海美吉生物医药科技公司进行454GS20FLX测序。结果：多样性分析结果显示,同一鼠种不同饮食组肠道菌群多样性存在差异,同时,同种饮食干预对肠道菌群多样性的影响在两种鼠种中也存在差异。Bal20b/c小鼠高脂组肠道菌群多样性最高,显著高于高纤维组、高蛋白组（P<0.05）。SD大鼠高蛋白组肠道菌群多样性最高,但无论是Bal20b/c小鼠还是SD大... 

【文章来源】：中南大学湖南省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：79 页

【学位级别】：博士

【文章目录】：
摘要
Abstract
目录
1 前言
    1.1 饮食对肠道菌群的影响
    1.2 研究饮食、肠道菌群及健康之间关系的策略
2 材料及方法
    2.1 主要仪器和设备
    2.2 试剂与材料
3 对象与分组
    3.1 实验动物
    3.2 饲料及配方
    3.3 动物分组及干预
4 实验方法
    4.1 动物喂养
    4.2 动物粪便的收集
    4.3 粪便细菌基因组总DNA的提取—QIAampDNA stool mini kit法
    4.4 16SrRNA基因序列V1-V3高变区PCR扩增
    4.5 PCR产物的定量、混匀及454焦磷酸测序
    4.6 序列的生物信息分析
5 统计学处理
6. 结果与分析
    6.1 丰度与多样性分析
    6.2 分类学分析
7 讨论
    7.1 肠道菌群微生物非培养研究方法
    7.2 不同饮食组肠道菌群多样性分析
    7.3 不同饮食组大小鼠各分类学水平上菌群组成差异
8 结论
参考文献
综述
    References
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]Probiotics20and20prebiotics20in20chronic20inflammatory20bowel20diseases[J]. Julia B Ewaschuk,Levinus A Dieleman.  World Journal of Gastroenterology. 2006(37)



本文编号：3177600