黄牛ACTL8基因的遗传变异及组织表达谱研究
发布时间：2024-03-24 17:07
肌动蛋白样蛋白8(actin-like 8,ACTL8)是肌动蛋白家族中的重要一员,在参与细胞分裂、细胞运动、信息传递等活动的同时,还具有内吞作用、细胞形态和极性维持等诸多功能,并与微管和中间丝(IF)共同构成细胞骨架。ACTL8具有对肌肉收缩的调节和稳定的作用,对肉的成熟嫩度有影响。但是目前对于ACTL8基因在黄牛肌肉中的作用机制尚不清楚,其与中国黄牛生长发育的关联性有待进一步研究。因此,本文以黄牛ACTL8基因为研究对象,探究该基因的遗传变异功能,同时对ACTL8基因在秦川牛不同年龄不同组织的表达量进行分析,以期得到相应的分子遗传学信息,找出对中国黄牛生长发育有显著影响的分子标记,为今后深入研究ACTL8基因在黄牛肌肉生长发育中的功能提供试验基础,并为我国黄牛遗传资源的保护、开发和使用提供遗传学依据。本论文的主要研究工作和结论如下:1.黄牛ACTL8基因的遗传多态性通过运用PCR-RFLP和DNA池测序技术,对394头秦川牛、213头夏南牛、180头晋南牛、82头郏县红牛、81头南阳牛和44头德南牛个体的ACTL8基因的单核苷酸多态性进行检测,结果检测到5个突变位点和2处插入缺失,...
【文章页数】：88 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
引言
文献综述
第一章 黄牛ACTL8基因遗传变异与功能的研究进展
1.1 黄牛品种简介
1.2 ACTL8基因的研究进展
1.2.1 肌动蛋白概况
1.2.2 ACTL8基因研究进展
1.2.3 ACTL8的生物学功能
1.2.4 ACTL8与细胞骨架
1.2.5 ACTL8与细胞运动
1.2.6 ACTL8与细胞分裂
1.2.7 ACTL8与肌肉
1.2.8 ACTL8与肿瘤
1.3 基因的单核苷酸多态性
1.4 聚合酶链式反应
1.5 全基因组选择技术
试验研究
第二章 黄牛ACTL8基因的遗传多样性
2.1 试验材料
2.1.1 黄牛血样样品
2.1.2 黄牛生长发育性状
2.1.3 试验所需试剂及仪器设备
2.1.4 试验所需试剂及溶液的配置
2.2 试验方法
2.2.1 牛基因组DNA的提取
2.2.2 DNA质量的检测
2.2.3 PCR引物的设计
2.2.4 PCR反应体系和扩增条件
2.2.5 酵切引物的设计
2.2.6 对酵切位点进行PCR扩增
2.2.7 酵切分析
2.3 统计分析
2.3.1 相关统计分析
2.3.2 相关分析统计模型
2.3.3 相关分析软件
2.4 结果与分析
2.4.1 牛基因组DNA样品质量的检测
2.4.2 牛ACTL8基因多态位点的检测分析
2.4.3 牛ACTL8基因插入缺失位点的验证分析
2.4.4 牛ACTL8基因多态位点酶切引物的设计
2.4.5 牛ACTL8基因多态位点酶切的鉴定结果
2.5 讨论
2.5.1 关于牛ACTL8基因多态位点检测方法的选择
2.5.2 牛ACTL8基因SNPs位点的分析
2.6 小结
第三章 黄牛ACTL8基因多态位点的群体遗传学数据分析
3.1 牛ACTL8基因SNP 1 位点的遗传多样性统计
3.2 牛ACTL8基因SNP 4 位点的遗传多样性统计
3.3 牛ACTL8基因SNP 5 位点的遗传多样性统计
3.4 牛ACTL8基因SNP 7 位点的遗传多样性统计
3.5 牛ACTL8基因SNP 8 位点的遗传多样性统计
3.6 牛ACTL8基因SNP 11位点的遗传多样性统计
3.7 牛ACTL8基因SNP 12位点的遗传多样性统计
3.8 牛ACTL8基因SNPS位点的连锁不平衡分析
3.8.1 秦川牛ACTL8基因SNPs位点的连锁不平衡分析
3.8.2 夏南牛ACTL8基因SNPs位点的连锁不平衡分析
3.8.3 德南牛ACTL8基因SNPs位点的连锁不平衡分析
3.8.4 南阳牛ACTL8基因SNPs位点的连锁不平衡分析
3.8.5 郏县红牛ACTL8基因SNPs位点的连锁不平衡分析
3.8.6 晋南牛ACTL8基因SNPs位点的连锁不平衡分析
3.9 讨论
3.9.1 哈代-温伯格平衡定律的生物学意义
3.9.2 连锁不平衡分析的生物学意义
3.10 小结
第四章 ACTL8基因多态性与六个黄牛品种主要生长性状的关联分析
4.1 黄牛部分生长性状和ACTL8基因SNPS的关联分析
4.1.1 秦川牛群体内ACTL8基因的SNPs突变位点与主要生长性状的关联分析
4.1.2 夏南牛群体内ACTL8基因的SNPs突变位点与主要生长性状的关联分析
4.1.3 郏县红牛群体内ACTL8基因的SNPs突变位点与主要生长性状的关联分析.414.1.4 德南牛群体内ACTL8基因的SNPs突变位点与主要生长性状的关联分析
4.1.5 南阳牛群体内ACTL8基因的SNPs突变位点与主要生长性状的关联分析
4.1.6 晋南牛群体内ACTL8基因的SNPs突变位点与主要生长性状的关联分析
4.2 讨论
4.3 小结
第五章 黄牛ACTL8基因的组织表达规律
5.1 试验材料和方法
5.1.1 试验动物和所需组织
5.1.2 试验所需试剂及溶液的配制和仪器设备
5.1.3 试验方法
5.2 结果与分析
5.2.1 组织RNA质量检测结果
5.2.2 定量引物质量检验结果
5.2.3 ACTL8基因在秦川牛不同生长阶段、不同组织的表达量
5.3 讨论
5.3.1 内参基因β-actin的选择
5.3.2 牛ACTL8基因的组织表达谱分析
5.4 小结
结论和创新点
试验结论
创新点
参考文献
附录
致谢
作者简介
本文编号：3937774
【文章页数】：88 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
引言
文献综述
第一章 黄牛ACTL8基因遗传变异与功能的研究进展
1.1 黄牛品种简介
1.2 ACTL8基因的研究进展
1.2.1 肌动蛋白概况
1.2.2 ACTL8基因研究进展
1.2.3 ACTL8的生物学功能
1.2.4 ACTL8与细胞骨架
1.2.5 ACTL8与细胞运动
1.2.6 ACTL8与细胞分裂
1.2.7 ACTL8与肌肉
1.2.8 ACTL8与肿瘤
1.3 基因的单核苷酸多态性
1.4 聚合酶链式反应
1.5 全基因组选择技术
试验研究
第二章 黄牛ACTL8基因的遗传多样性
2.1 试验材料
2.1.1 黄牛血样样品
2.1.2 黄牛生长发育性状
2.1.3 试验所需试剂及仪器设备
2.1.4 试验所需试剂及溶液的配置
2.2 试验方法
2.2.1 牛基因组DNA的提取
2.2.2 DNA质量的检测
2.2.3 PCR引物的设计
2.2.4 PCR反应体系和扩增条件
2.2.5 酵切引物的设计
2.2.6 对酵切位点进行PCR扩增
2.2.7 酵切分析
2.3 统计分析
2.3.1 相关统计分析
2.3.2 相关分析统计模型
2.3.3 相关分析软件
2.4 结果与分析
2.4.1 牛基因组DNA样品质量的检测
2.4.2 牛ACTL8基因多态位点的检测分析
2.4.3 牛ACTL8基因插入缺失位点的验证分析
2.4.4 牛ACTL8基因多态位点酶切引物的设计
2.4.5 牛ACTL8基因多态位点酶切的鉴定结果
2.5 讨论
2.5.1 关于牛ACTL8基因多态位点检测方法的选择
2.5.2 牛ACTL8基因SNPs位点的分析
2.6 小结
第三章 黄牛ACTL8基因多态位点的群体遗传学数据分析
3.1 牛ACTL8基因SNP 1 位点的遗传多样性统计
3.2 牛ACTL8基因SNP 4 位点的遗传多样性统计
3.3 牛ACTL8基因SNP 5 位点的遗传多样性统计
3.4 牛ACTL8基因SNP 7 位点的遗传多样性统计
3.5 牛ACTL8基因SNP 8 位点的遗传多样性统计
3.6 牛ACTL8基因SNP 11位点的遗传多样性统计
3.7 牛ACTL8基因SNP 12位点的遗传多样性统计
3.8 牛ACTL8基因SNPS位点的连锁不平衡分析
3.8.1 秦川牛ACTL8基因SNPs位点的连锁不平衡分析
3.8.2 夏南牛ACTL8基因SNPs位点的连锁不平衡分析
3.8.3 德南牛ACTL8基因SNPs位点的连锁不平衡分析
3.8.4 南阳牛ACTL8基因SNPs位点的连锁不平衡分析
3.8.5 郏县红牛ACTL8基因SNPs位点的连锁不平衡分析
3.8.6 晋南牛ACTL8基因SNPs位点的连锁不平衡分析
3.9 讨论
3.9.1 哈代-温伯格平衡定律的生物学意义
3.9.2 连锁不平衡分析的生物学意义
3.10 小结
第四章 ACTL8基因多态性与六个黄牛品种主要生长性状的关联分析
4.1 黄牛部分生长性状和ACTL8基因SNPS的关联分析
4.1.1 秦川牛群体内ACTL8基因的SNPs突变位点与主要生长性状的关联分析
4.1.2 夏南牛群体内ACTL8基因的SNPs突变位点与主要生长性状的关联分析
4.1.3 郏县红牛群体内ACTL8基因的SNPs突变位点与主要生长性状的关联分析.414.1.4 德南牛群体内ACTL8基因的SNPs突变位点与主要生长性状的关联分析
4.1.5 南阳牛群体内ACTL8基因的SNPs突变位点与主要生长性状的关联分析
4.1.6 晋南牛群体内ACTL8基因的SNPs突变位点与主要生长性状的关联分析
4.2 讨论
4.3 小结
第五章 黄牛ACTL8基因的组织表达规律
5.1 试验材料和方法
5.1.1 试验动物和所需组织
5.1.2 试验所需试剂及溶液的配制和仪器设备
5.1.3 试验方法
5.2 结果与分析
5.2.1 组织RNA质量检测结果
5.2.2 定量引物质量检验结果
5.2.3 ACTL8基因在秦川牛不同生长阶段、不同组织的表达量
5.3 讨论
5.3.1 内参基因β-actin的选择
5.3.2 牛ACTL8基因的组织表达谱分析
5.4 小结
结论和创新点
试验结论
创新点
参考文献
附录
致谢
作者简介
本文编号：3937774
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