鸭源H7N9亚型禽流感病毒感染SPF鸡转录组学分析

发布时间：2024-05-26 23:22

　　目的为了分析鸭源H7N9亚型禽流感病毒感染SPF鸡后宿主基因表达水平的变化。方法以鸭源H7N9亚型禽流感病毒感染SPF鸡,收集肺脏进行高通量测序。结果与对照组相比,感染组得到差异表达基因740个,其中上调基因有602个,下调基因有138个。GO条目分析发现,差异基因主要涉及免疫应答反应和炎症反应等。经KEGG数据库比对注释及富集分析显示有7个通路富集显著,其中Toll-like信号通路有11个基因表达上调,分别为IL-6、TLR4、PIK3、IRF7、MD-2、IRF5、MYD88、CD86、STAT1、TLR2和CCL4,NOD-like受体信号通路有7个基因表达上调,分别为IRF7、CTSB、P2RX7、CYBB、PSTPIP1、HSP90AA1和NAMPT。结论鸭源H7N9亚型病毒感染SPF鸡后,免疫相关基因表达明显增强。在Toll-like信号通路中, TLR4在MD-2的协助下被激活,随后依赖MYD88途径激活下游的IRF5,继而引起CCL4、IL-6显著表达。同时NLRP3炎症体在H7N9亚型病毒感染过程中也发挥着重要作用。

【文章页数】：8 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 毒株和实验动物
    1.2 动物致病性试验
    1.3 高通量测序用SPF鸡肺脏的采集
    1.4 RNA的抽提与纯化
    1.5 高通量测序
    1.6 测序结果的分析
        1.6.1 差异表达基因的筛选
        1.6.2 差异表达基因的GO和KEGG分析
    1.7 细胞因子的qPCR验证
2 结 果
    2.1 鸭源H7N9病毒对SPF鸡的致病性
    2.2 高通量测序数据质量检测
    2.3 转录组差异表达
    2.4 转录组GO数据库注释及显著性富集分析
    2.5 转录组KEGG数据库注释及显著性富集分析
    2.6 差异表达基因的qRT-PCR验证
3 讨 论



本文编号：3982441