microRNA在树鼩真菌性角膜炎中的调控网络及其生物学功能分析

发布时间：2023-11-24 21:58

　　筛选树鼩真菌性角膜炎发病过程中差异表达的微小RNA(microRNA,miRNA)和信使RNA(mRNA),分析其靶基因的生物学功能及信号通路,为阐明真菌性角膜炎的免疫机制及筛选其抗真菌治疗的潜在靶点提供线索。通过茄病镰刀菌液显微注射至树鼩角膜基质,诱导真菌性角膜炎的发生;使用高通量测序技术检测茄病镰刀菌感染树鼩第7天、14天和30天的角膜组织miRNA和mRNA表达谱,以自身未感染的眼角膜为对照;差异表达miRNAs的靶基因与差异表达mRNAs取交集构建miRNA-mRNA调控网络,采用实时荧光定量PCR进行验证;最后对靶基因进行GO和KEGG富集分析。结果表明:在茄病镰刀菌感染树鼩角膜第7天、14天和30天,分别有78、56、41个mRNAs和70、63、20个miRNAs显著性差异表达,其中有29个mRNAs和14个miRNAs在感染第7天、14天和30天均显著性差异表达,Has-miR-214-3p和Has-miR-149-5p处于调控网络的关键节点。GO和KEGG富集分析发现,显著性差异表达的mRNAs和miRNAs靶基因主要参与免疫反应和炎症反应,涉及Toll-like受体...

【文章页数】：11 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 实验动物
    1.2 茄病镰刀菌
    1.3 实验方法
        1.3.1 树鼩真菌性角膜炎模型的建立
        1.3.2 角膜组织总RNA提取
        1.3.3 文库构建及测序
        1.3.4 RNA测序数据输出与过滤
        1.3.5 筛选差异表达miRNAs和mRNAs
        1.3.6 miRNA-mRNA调控网络构建
        1.3.7 实时荧光定量PCR(qPCR)验证miRNA的表达水平
        1.3.8 miRNA靶基因预测及富集分析
    1.4 统计分析
2 结果
    2.1 树鼩真菌感染角膜的症状及病理学特征
    2.2 RNA测序数据特征
    2.3 差异表达miRNAs和mRNAs分析
    2.4 构建的miRNA-mRNA调控网络
    2.5 qPCR验证miRNA表达水平
    2.6 miRNA靶基因GO功能和KEGG信号通路富集分析
3 讨论
4 结论



本文编号：3866676