基于生物信息学的麻疹病毒分子进化及肠道病毒鉴定分型研究

发布时间：2023-03-27 04:47

　　现在人类已经鉴定了超过5000种类型的病毒。某些病毒可直接引起人类疾病，如流感、水痘，以及天花、艾滋病、SARS和禽流感等严重疾病，另外还有一些病毒可作为某些疾病的诱发因子，如疱疹病毒6型可引起一些神经性疾病，某些病毒可能引起人的慢性疲劳综合征。近年来随着新一代测序技术的发展，越来越多的病毒基因组被测序，截止2013年3月，NCBI上已发表的病毒基因组已有3251种。如何利用先进的生物信息学技术分析这些已经发表的海量病毒基因组资源，从而更科学地研究病毒的进化及鉴定分型是我们迫切需要解决的问题。本研究应用最新的贝叶斯-马科夫链的分子进化方法对测序麻疹病毒N基因进行分子进化分析，同时应用基于基因组信息挖掘的基因组条形码技术对肠道病毒进行鉴定与分类，从而将生物信息学技术与病毒学进行交叉融合，为传统微生物学研究技术难以解决的病毒进化及鉴定分型提供崭新的研究视角，并为更好地理解病毒性疾病的发生与发展做出贡献。 第一部分基于贝叶斯-马科夫链的麻疹病毒分子进化研究 麻疹病毒（measles virus，MV）属于副粘病毒科麻疹病毒属，具有高度的传染性，感染人体后可引起麻疹及严重的并发症，包括巨细胞肺...

【文章页数】：94 页

【学位级别】：博士

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中文摘要
Abstract
第一章 引言
    1.1 生物信息学
        1.1.1 生物信息学概述
        1.1.2 生物信息学研究的主要内容
    1.2 生物信息学在病毒领域的应用
        1.2.1 后基因组病毒学
        1.2.2 病毒抗原表位预测
        1.2.3 病毒宏基因组学研究
    1.3 本研究的目的
第二章 基于贝叶斯推测方法的麻疹病毒的进化研究
    2.1 引言
        2.1.1 麻疹病毒概述及基因组特征
        2.1.2 麻疹病毒株的基因型
        2.1.3 系统发育及重建方法
        2.1.4 贝叶斯推断方法的特点及优势
    2.2 吉林省 16 株代表性麻疹病毒及所有学术发表 N 基因的系统进化分析
        2.2.1 材料
        2.2.2 实验方法
        2.2.3 结果
        2.2.4 讨论
第三章 基于基因组条形码技术的肠道病毒的分类与分型
    3.1 引言
        3.1.1 肠道病毒基因组的特征与分类
        3.1.2 基因树冲突与系统发育基因组学研究
        3.1.3 系统发育基因组学
        3.1.4 基因组条形码技术
    3.2 基于基因组条形码技术的肠道病毒的分类与分型
        3.2.1 数据及方法
        3.2.2 结果
        3.2.3 讨论
第四章 结论
参考文献
附录
作者简介及在学期间所取得的科研成果
致谢



本文编号：3772421