LncRNA在非动脉炎性前部缺血性视神经病变患者外周血中的表达谱分析

发布时间：2023-04-30 00:46

　　目的:本研究对非动脉炎性前部缺血性视神经病变患者与健康正常人血样进行高通量测序并对其转录组数据进行分析,筛选出差异表达的LncRNA并分析其表达谱,研究LncRNA与NAION发生发展的关系,以期发现可作为NAION诊断与治疗靶点的Lnc RNA。方法:提取6例NAION患者和5例健康对照组外周血细胞中RNA,应用高通量测序方法进行转录组测序,筛选出差异表达的LncRNA,并对得到的LncRNA进行转录组表达谱分析,通过生物信息学方法对差异表达的LncRNA进行功能分析、聚类分析和生物学预测。根据生物信息学结果,经qRT-PCR技术进一步验证筛选出的Lnc RNA的表达情况。结果:(1)通过高通量测序,发现NAION患者外周血中996个表达差异显著的LncRNA。其中上调LncRNA有317个,下调Lnc RNA有679个(变化倍数>2倍(2)通过GO数据库分析,差异表达的LncRNA参与NAION相关的多种生物学过程,如细胞凋亡,脂质代谢,MAPK信号通路,炎症反应,氧化应激等。(3)经qRT-PCR方法将筛选出的6个Lnc RNA在细胞水平进行表达验证,发现与基因芯片检测结果...

【文章页数】：39 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
英文缩略语
1 前言
2 材料和方法
    2.1 主要试剂和仪器设备
        2.1.1 主要试剂
        2.1.2 主要仪器设备
    2.2 研究对象和分组
        2.2.1 纳入与排除标准
    2.3 提取外周血RNA
    2.4 基因芯片数据分析
    2.5 荧光定量PCR验证
    2.6 GO和 KEGG富集分析
    2.7 共表达分析
3 结果
    3.1 测序结果汇总统计
    3.2 基因表达差异分析
    3.3 差异基因GO富集分析
    3.4 差异基因KEGG富集分析
    3.5 互作网络
    3.6 qRT-PCR验证差异表达的Lnc RNA
4 讨论
本研究创新性的自我评价
参考文献
综述
    参考文献
攻读学位期间取得的研究成果
致谢
个人简历



本文编号：3806074