老年性白内障患者外周血环状RNA差异表达谱研究

发布时间：2024-03-16 08:38

　　目的利用微阵列芯片技术筛选老年性白内障患者外周血中差异性表达的环状RNA(circular RNAs,circRNAs)进行生物信息学数据预测和分析,以探究外周血circRNAs在老年性白内障发病中的作用。方法选取成都医学院第一附属医院已诊断为老年性白内障患者3例(试验组)和健康体检者3人(对照组)作为研究对象,运用Arraystar circRNAs基因芯片技术检测两组外周血中circRNAs表达谱及分析两组间差异表达的circRNAs。同时,运用在线生物信息学软件对差异circRNAs进行分析以及对下游相互作用的微小RNA(miRNA)进行预测。结果与对照组比较,试验组外周血中异常表达的circRNAs共有242个(fold change绝对值≥2.0),其中上调的100个(fold change≥2.0),下调的142个(fold change≤-2.0);生物信息分析数据提示,差异circRNAs在调节细胞代谢、发育及RNA转录等功能方面高度富集;4个circRNAs与白内障相关的miR-15a-3p、miR-34a-5p等吸附相关miRNA可能具有miRNA海绵吸附作用。结论...

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图1总RNA凝胶电泳图

表1试验组和对照组总RNA浓度和质量样本号光密度比值(D260/D280)光密度比值(D260/D230)浓度/mg·L-1体积/μLRNA质量/ngC11.821.98206.62153099.30C21.871.86386.3715579....

图2差异circRNAs表达谱图

利用生物信息学工具,将试验组和对照组分析获得的差异circRNAs绘制成散点图(见图2)。结果显示,与对照组比较,试验组外周血中异常表达的circRNAs共有242个(foldchange绝对值≥2.0),其中上调的有100个(foldchange≥2.0),差异倍数>3的有....

图3上调与下调差异circRNAs的GO富集分析及KEGG富集分析

表4差异表达的circRNAs与下游靶向吸附miRNA的预测结果circRNAs名称Foldchange值吸附相关miRNAhsa_circRNA_1025342.3397457miR-432-5p、miR-766-5p、miR-874-5p、miR-34....

本文编号：3929397