乌苏里貉KIT基因及编码蛋白生物信息学分析

发布时间：2024-02-15 08:08

　　KIT基因表达量通常与黑色素含量呈正比,通过3种毛色乌苏里貉KIT基因转录本定量表达分析发现,白貉KIT基因表达量较高,为探究乌苏里貉KIT基因及编码蛋白结构特性,使用基于机器学习和神经网络算法软件对其编码蛋白结构作全面生物信息学分析。结果表明,乌苏里貉KIT基因编码蛋白含有972个氨基酸,属于酸性亲水型蛋白,无规则卷曲为主要二级结构,存在两个跨膜区,细胞膜外侧存在信号肽,含有21个糖基位点,60个磷酸化位点,4个保守结构域,与5个蛋白密切作用,系统发育树构建结果与生物学分类一致。分析结果为进一步研究乌苏里貉KIT蛋白生物学特性奠定基础。

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【部分图文】：

图1乌苏里貉KIT蛋白亲水性和疏水性分析

在线工具Proscal分析亲水性和疏水性结果表明，乌苏里貉KIT基因编码蛋白中疏水性氨基酸（Ala、Val、Leu、Ile、Phe、Trp、Met、Pro)399个，亲水性氨基酸（Gly、Thr、Ser、Cys、Asn、Gln、Tyr、Lys、Arg、His、Asp、Glu)57....

图2乌苏里貉KIT蛋白跨膜区

在线SignalP软件预测该蛋白质信号肽结果显示，该蛋白在第1～25位氨基酸为信号肽序列，因此推测该蛋白为分泌型蛋白（见图3）。图3乌苏里貉KIT蛋白信号肽预测

图3乌苏里貉KIT蛋白信号肽预测

图2乌苏里貉KIT蛋白跨膜区2.5.2保守结构域

图4KIT蛋白结构域

NCBIConservedDomain预测结果表明，乌苏里貉KIT蛋白共有4个保守结构域，包括2个免疫球蛋白结构域（Ig），分别位于第216～305、426～505位氨基酸残基，1个干细胞因子受体第四免疫球蛋白样域（Ig4＿SCFR），位于第311～411位氨基酸残基，1个蛋....

本文编号：3899457