基于基因芯片技术初步探讨NAT2与晚期胆管癌预后的相关性

发布时间：2024-03-26 03:27

　　目的:寻找与胆管癌预后密切相关的关键基因,探索该基因与胆管癌预后的临床相关性。方法:在GEO数据库中检索胆管癌表达谱芯片,通过GEO2R分析得到在不同芯片数据中均差异表达的关键基因,将差异基因利用DAVID数据库进行GO生物学过程富集分析和KEGG通路富集分析,并利用TCGA数据库及OncoLnc在线生存分析明确差异基因与胆管癌预后的关系,通过临床数据验证这一相关性,并由STRING数据库对可能机制进行探索,为后续研究提供方向。结果:检索到3个胆管癌相关基因芯片,通过差异分析得到127个基因在3个基因芯片中均有差异表达,GO富集及KEGG通路分析显示差异基因主要参与氧化还原、细胞色素P450途径、叶酸代谢等过程,TCGA、OncoLnc在线生存分析提示NAT2与胆管癌预后密切相关。收集临床经晚期标准化疗的胆管癌患者组织及血液学样本38例,采集临床数据并送检SNP基因测序,结果显示NAT2突变型的疾病控制率为76.19%,显著高于野生型的35.29%,差异有统计学意义(P<0.05),提示突变型NAT2预后较好。利用STRING数据库对NAT2基因进行蛋白互作分析,推测NAT2、C...

【文章页数】：8 页

【文章目录】：
1 资料与方法
    1.1 基因芯片的选取及差异基因的筛选
    1.2 差异基因的生物学功能及通路分析
    1.3 关键基因与胆管癌预后的相关性分析
    1.4 绘制目标基因蛋白-蛋白相互作用图
    1.5 临床数据检验
    1.6 统计学方法
2 结果
    2.1 差异基因的筛选
    2.2 差异基因的生物学功能及通路分析
    2.3 关键基因对胆管癌预后的影响
    2.4 临床数据检验
    2.5 寻找可能的作用机制
3 讨论



本文编号：3939298