耐水湿竹种SSR引物筛选及基于ISSRs标记的耐水湿竹种亲缘关系研究

发布时间：2023-10-21 14:19

　　竹类植物是禾本科(Gramineae)竹亚科(Bambusoideae)植物的总称,是森林资源的重要构成部分。我国南方地区的沿江滩涂地以及低湿地竹类资源较丰富,这些耐水湿竹类对于土地资源的利用、调整当地农村产业结构以及改善当地的生态环境具有重要的作用,但一些竹种之间的亲缘关系尚存在争议,影响了一些竹种的科学和有效的利用。本论文主要对刚竹属、苦竹属和箬竹属共3个属11个耐水湿竹种进行了两方面的研究:(1)耐水湿竹种SSR-PCR反应体系的建立和优化及SSR引物筛选;(2)基于ISSRs的耐水湿竹种的遗传多样性及亲缘关系研究。研究结果如下:1.采用正交试验设计和单因素分析方法建立和优化了耐水湿竹种SSR-PCR反应体系,筛选了SSR引物。反应体系总体积为20.0μL:模板DNA(5-10 ng·μL-1)1.1μL、dNTP(10 mmol·L-1)0.44μL、正反向引物(10μmol·L-1)0.26μL、Mg2+(25 mmol·L-1)2.0μL、Taq DNA聚合酶(5 U·μL-1)0.8μL、10×PCR缓冲液2.0μL、HPLC超纯水13.14μL。PCR扩增程序为:94℃...

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摘要
Abstract
1 文献综述
    1.1 竹子简介
    1.2 竹类研究现状
        1.2.1 繁殖技术研究
        1.2.2 遗传学研究
    1.3 DNA分子标记技术
        1.3.1 常见分子标记技术简介
            1.3.1.1 RFLP分子标记（限制性内切酶片段长度多态性）
            1.3.1.2 RAPD分子标记（随机扩增DNA多态性）
            1.3.1.3 AFLP分子标记（扩增片段长度多态性）
            1.3.1.4 SCAR分子标记（序列特异扩增区域）
            1.3.1.5 SRAP分子标记技术（相关序列扩增多态性）
            1.3.1.6 SSR分子标记（微卫星标记）
            1.3.1.7 ISSR分子标记（简单序列重复区间扩增多态性）
        1.3.2 基于分子标记的竹亚科研究
    1.4 遗传变异的量化
        1.4.1 基本的遗传参数
        1.4.2 遗传变异的度量
    1.5 研究内容、目的和意义
2 耐水湿竹种SSR-PCR反应体系的建立、优化和引物筛选
    2.1 引言
    2.2 材料与方法
        2.2.1 实验材料
        2.2.2 竹子DNA的提取与检测方法
        2.2.3 耐水湿竹种SSR-PCR反应体系建立及优化
        2.2.4 耐水湿竹种SSR引物筛选
    2.3 结果与分析
        2.3.1 供试材料DNA的检测
        2.3.2 正交试验
        2.3.3 SSR-PCR体系优化
        2.3.4 SSR引物筛选
    2.4 讨论和结论
3 基于ISSR-PCR的耐水湿竹种遗传多样性及亲缘关系分析
    3.1 引言
    3.2 材料与方法
        3.2.1 材料
        3.2.2 实验方法
    3.3 结果与分析
        3.3.1 ISSR引物筛选
        3.3.2 耐水湿竹属遗传多样性
        3.3.3 耐水湿竹属遗传距离及亲缘关系分析
        3.3.4 耐水湿竹种亲缘关系
    3.4 讨论
        3.4.1 ISSR反应体系的优越性
        3.4.2 ISSR反应体系的优化
        3.4.3 ISSR在研究耐水湿竹种间亲缘关系的适用性
        3.4.4 耐水湿竹种遗传多样性
        3.4.5 斑苦竹归属
        3.4.6 ISSR引物特异性条带
        3.4.7 展望
    3.5 结论
参考文献
附图
附录
    附录A SSR-PCR反应规程
    附录B ISSR-PCR反应规程
    附录C ISSR引物序列（UBC Set
    附录D 基于ISSRS的耐水湿竹种遗传多样性参数
    附录E 耐水湿竹种的主坐标分析图
致谢
个人简历



本文编号：3856002