福建青冈和岭南青冈系统发育关系及居群遗传结构

发布时间：2023-10-22 11:13

　　福建青冈(Quercus chungii F.P.Metcalf)和岭南青冈(Q.championii Benth.)属于栎属青冈组(Quercus section Cyclobalanopsis),为珍稀用材树种,是我国东南地区亚热带常绿阔叶林重要组成树种之一。这两个物种形态相似,被认为是姐妹种,但还缺乏分子证据支持。了解福建青冈和岭南青冈分布范围、系统发育关系、居群空间遗传格局及其演化历史,不仅是科学制定其遗传资源保护与开发利用策略的理论基础,也为揭示中国南部物种迁移扩散丰富证据。本研究基于物种潜在分布区模型,微卫星分型和简化基因组测序技术开展福建青冈和岭南青冈的系统演化关系、潜在分布区域及居群遗传结构的研究,主要结果如下:(1)福建青冈和岭南青冈系统关系及变异位点在基因组上分布利用简化基因组测序技术对福建青冈和岭南青冈及9个近缘物种27个样本进行测序。构建的贝叶斯树和极大似然树显示福建青冈和岭南青冈不是姐妹类群,其中福建青冈与大果青冈(Q.rex)、越南青冈(Q.austrocochinchiensis)、毛叶青冈(Q.kerrii)、绒毛青冈(Q.hypophaea)和黄毛青冈...

【文章页数】：114 页

【学位级别】：博士

【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
1 绪论
    1.1 居群遗传学所用遗传标记及分析方法
        1.1.1 遗传标记发展
        1.1.2 溯祖理论及在居群遗传学中应用
        1.1.3 居群遗传学与物种分布区模型的结合
        1.1.4 居群应对气候变化的遗传学基础
    1.2 中国南部植物演化历史研究进展
        1.2.1 中国东南物种多样性分布及冰期避难所
        1.2.2 中国东南部临近岛屿植物区系的形成
    1.3 福建青冈和岭南青冈研究概况
        1.3.1 栎属分类及分布
        1.3.2 福建青冈和岭南青冈形态特征
        1.3.3 福建青冈和岭南青冈群落结构和生理生态特征
        1.3.4 福建青冈和岭南青冈居群遗传学研究进展
    1.4 研究目的、意义和技术路线
        1.4.1 研究目的和意义
        1.4.2 技术路线
2 福建青冈和岭南青冈系统位置
    2.1 材料与方法
        2.1.1 样本选择及DNA提取
        2.1.2 酶切建库测序
        2.1.3 变异信息检测
        2.1.4 系统发育树构建
        2.1.5 变异位点在基因组中分布
    2.2 结果与分析
        2.2.1 物种间变异信息
        2.2.2 物种间系统进化关系
        2.2.3 变异信息在基因组中分布
    2.3 讨论
        2.3.1 福建青冈和岭南青冈系统关系
        2.3.2 变异信息在基因组中分布
    2.4 小结
3 福建青冈和岭南青冈潜在分布范围
    3.1 材料与方法
        3.1.1 物种分布及环境数据获取
        3.1.2 物种潜在分布范围模拟
        3.1.3 福建青冈和岭南青冈生境比较
    3.2 结果与分析
        3.2.1 福建青冈和岭南青冈潜在分布范围
        3.2.2 福建青冈和岭南青冈生境差异
    3.3 讨论
        3.3.1 潜在分布区模拟性能
        3.3.2 福建青冈和岭南青冈生境差异
    3.4 小结
4 福建青冈居群遗传结构
    4.1 材料与方法
        4.1.1 样本采集及基因分型
        4.1.2 居群遗传多样性及遗传结构分析
        4.1.3 福建青冈景观遗传格局分析
    4.2 结果与分析
        4.2.1 遗传多样性和遗传结构
        4.2.2 福建青冈景观遗传格局
    4.3 讨论
        4.3.1 福建青冈潜在冰期避难所
        4.3.2 福建青冈扩散廊道
        4.3.3 福建青冈的保护和管理
    4.4 小结
5 岭南青冈的空间遗传结构及演化历史
    5.1 材料与方法
        5.1.1 样本采集及测序
        5.1.2 数据过滤及参数优化
        5.1.3 遗传多样性及遗传结构
        5.1.4 个体系统发育关系
        5.1.5 居群演化历史
        5.1.6 景观基因组格局
    5.2 结果与分析
        5.2.1 测序数据质控
        5.2.2 分析参数优化
        5.2.3 遗传多样性及遗传结构
        5.2.4 个体系统发育关系
        5.2.5 居群演化历史
        5.2.6 景观基因组格局
    5.3 讨论
        5.3.1 简化基因组标记的准确性
        5.3.2 岭南青冈起源及迁移路线
        5.3.3 岭南青冈遗传结构及基因渗入
        5.3.4 岭南青冈对局部环境的适应
    5.4 小结
6 结论、创新点与展望
    6.1 结论
    6.2 创新点
    6.3 展望
参考文献
附录 :攻读学位期间主要学术成果
致谢



本文编号：3856405