大豆巢式关联作图群体QTL定位方法的优化并用于开花期与籽粒性状的遗传解析

发布时间：2024-06-30 09:20

　　大多数农艺、品质性状是由多基因控制的复杂性状,并且往往受到环境互作的高度影响。连锁定位和关联定位是解析复杂性状遗传结构的两种常用方法,基于双亲本分离群体的连锁定位方法,只能鉴定两亲本之间的多态性基因位点,而基于自然群体的关联分析方法,能够检测同一位点的多个等位变异。连锁定位初步确定目标性状QTL的位置,关联分析可快速对目标基因进行精细定位,关联分析和连锁定位可以相互补充。巢式关联作图(Nested Association Mapping,NAM)群体,是由一个共同亲本与其他多个亲本分别杂交而构建的多个重组自交系群体的总和,利用了多亲本之间更多的遗传变异以及群体大小增加,NAM成为解析复杂性状解剖的很有发展前景的多亲本遗传设计。该群体的亲本数目相对有限,其中一个共同亲本是固定的,能够相对较好地区分群体结构,在进行关联分析时,可以考虑群体结构对关联结果造成的影响。NAM群体成为解析复杂性状的多亲本遗传设计之一。本研究构建了具有共同亲本(M8206)的四个大豆重组自交系群体(LM、ZM、MT和MW),整合为一个 LZTWM 群体,并利用 RAD-seq(Restriction-site as...

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【学位级别】：博士

【部分图文】：

图１－４本研究技术路线??Ｆｉｇ．?１－４?Ｔｈｅ?ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ?ｒｏｕｔｅ?ｏｆ?ｔｈｉｓ?ｓｔｕｄｙ??

型的复合区间联作图混合线性顯关联分析全基隨关联分析方法??（ＵＭ），￡?作图（ＭＣ＇ＩＭＩ?法?（．丨丨?方法（ＭＬＭ－ＧＷＡＳ）?（ＲＴＭ－ＧＷＡＳ）??１?Ｉ?Ｉ?Ｉ?Ｉ??以开花期性状作为研究对象，鉴定Ｌ７ＴＷＶ１群体的高效ＱＴＬ定位方法??—?Ｉ?￣￣??Ｉ?，?，?１?....

图４－丨ＬＺＴＷＭ群体利用ＳＮＰＬＤＢｓ标记ＲＴＭ－ＧＷＡＳ方法法检测到的开花期（ＤＴＦ）位点的曼哈顿图??（左）与ＱＱ图（右）??Ｆ?

?第四章巢式关联作图群体开花期性状的遗传解析???第一阶段，利用一般线性模型（ｇｅｎｅｒａｌ?ｌｉｎｅａｒ?ｍｏｄｅｌ，ＧＬＭ）方法，为检测出更多可能??存在的开花期相关位点，显著性阈值设定为Ｐ＜〇．〇５，在６，１３７个ＳＮＰＬＤＢｓ标记中检测??到４，５４４个ＳＮＰＬＤＢｓ与开....

图４－２?ＬＺＴＷＭ群体ＲＴＭ－ＧＷＡＳ方?

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图７－２?ＬＺＴＷＭ群体ＲＴＭ－ＧＷＡＳ方法法检测到的蛋白质含量ＱＴＬ等位变异效?

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本文编号：3998649