基于GEO数据库的不明原因复发性自然流产患者子宫内膜差异基因筛选及其生物信息学分析

发布时间：2021-12-18 04:31

　　目的探讨不明原因复发性自然流产（URSA）患者子宫内膜差异基因筛选及其相关信号通路及生物学过程。方法在基因表达总览（GEO）数据库中,以"recurrent spontaneous abortion""recurrent pregnancy loss""endometrium""homo sapiens"为关键词,检索URSA患者子宫内膜基因芯片数据集。利用R语言对URSA患者子宫内膜基因芯片数据进行分析,筛选差异基因,并对不同芯片数据集间差异基因取交集,获得共同差异基因。利用David数据库对共同差异基因的基因本体（GO）及京都基因与基因组百科全书（KEGG）信号通路进行富集分析。利用STRING数据库对这些基因数据集的差异基因编码蛋白的蛋白质与蛋白质相互作用（PPI）网络进行构建,并采用Cytoscape软件（v3.0）进行可视化。结果 （1）本研究获得GSE26787和GSE65099共计2个URSA患者子宫内膜基因数据集,对这2个数据集差异基因取交集,最终获得23个共差异基因,其中上调基因为19个,分别为ADM2、SH3D21、FGFR4、SULT2B1、NRG2、SERPIN... 

【文章来源】：中华妇幼临床医学杂志(电子版). 2020,16(05)

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

GSE26787数据集差异表达基因热图

GSE65099数据集差异表达基因热图

GSE26787和GSE65099数据集差异基因PPI网络图

【参考文献】：
期刊论文
[1]The present and future of whole-exome sequencing in studying and treating human reproductive disorders[J]. Wei Guo,Xiaohui Zhu,Liying Yan,Jie Qiao.  Journal of Genetics and Genomics. 2018(10)
[2]复发性自然流产夫妇的病因分析[J]. 符梅,徐克惠.  中华妇幼临床医学杂志(电子版). 2016(04)
[3]不明原因复发性流产发病机制研究进展[J]. 马韵,郑梅玲.  中华妇幼临床医学杂志(电子版). 2016(02)



本文编号：3541636