嗜根考克氏菌双组分信号转导系统的生物信息学分析

发布时间：2022-12-04 08:19

　　双组分信号转导系统（two-component system, TCS）是细菌感知和响应环境的普遍机制,由组氨酸激酶（histidine kinase, HK）和应答调控蛋白（response regulator, RR）组成,它们能够使机体根据环境条件的改变做出适当的细胞反应。嗜根考克氏菌（Kocuria rhizophila）是一种抗生素活性测试的常用质量控制菌株,但目前有关它的TCS研究尚不多见。为研究TCSs在细菌生存适应中的潜在作用,采用生物信息学的方法对已完成基因组测序的8个嗜根考克氏菌菌株的TCSs进行数量统计、结构分析以及功能预测。研究结果显示,嗜根考克氏菌中共存在13种TCSs,且HKs和RRs都是模块化蛋白质,参与外界压力应答、细胞壁合成、酶活性、物质代谢与运输等生命活动。本研究关于TCSs的研究将有助于系统的理解嗜根考克氏菌以及相关物种,为构建该菌的TCS调控网络提供依据,并可推动其在工业上的应用。 

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【文章目录】：
1 结果与分析
    1.1 嗜根考克氏菌的基因组信息
    1.2 嗜根考克氏菌中的TCS分布
    1.3 嗜根考克氏菌HKs和RRs的结构组成和分布
    1.4 嗜根考克氏菌TCSs的功能预测
2 讨论
3 材料与方法
    3.1 基因组序列来源
    3.2 HKs和RRs的鉴定及结构分析
    3.3 HKs和RRs的功能预测
作者贡献



本文编号：3707909