甜瓜GRF转录因子的全基因组鉴定和分析

发布时间：2023-02-05 17:42

　　生长调节因子(growth-regulating factor, GRF)在调节植物生长和发育方面起到重要的调控作用,在拟南芥中研究发现,GRF家族蛋白具有正向调控茎和叶生长发育的生物学功能,并且不同植物间、同一物种的不同成员间其生物学功能又存各异。本研究应用生物信息学方法,在甜瓜全基因组中鉴定得到7个GRF家族成员,命名为CmGRF1～CmGRF7,对理化性质、基因结构、保守基序及进化关系进行预测和分析。结果表明,CmGRF基因均含有3～4个不同的内含子,进化分析将GRF蛋白分为2种不同的类型(ClassⅠ, ClassⅡ),甜瓜与黄瓜的GRF蛋白聚类在一起并且在同一组聚类中具有非常高的自举值,WRC和QLQ是GRF蛋白特有的保守基序,在所有的预测蛋白中鉴定得到。通过甜瓜GRFs基因家族的系统分析,为进一步阐明甜瓜中GRF蛋白结构及功能提供科学依据和有价值的资料。

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【文章目录】：
1 结果与分析
    1.1 甜瓜GRFs基因家族成员的鉴定
    1.2 甜瓜GRF基因的理化性质、结构的分析
    1.3 甜瓜GRFs基因家族的系统发生树和基序分析
    1.4 GFR家族基因表达谱构建结果与分析
2 讨论
3 材料与方法
    3.1 甜瓜GRF家族基因的搜索及鉴定
    3.2 甜瓜GRF基因的理化性质、结构的分析
    3.3 甜瓜GRF家族基因的进化及基序分析
    3.4 甜瓜GRF家族基因的表达谱构建
作者贡献



本文编号：3735406