芝麻CCCH锌指蛋白基因SiC3H1的克隆及表达分析

发布时间：2023-02-25 23:17

　　CCCH锌指蛋白是真核生物中广泛存在的一类转录调节因子,在植物生长发育及逆境胁迫应答中具有重要功能。本研究基于芝麻转录组数据,筛选并克隆到一个芝麻干旱应答相关的CCCH锌指蛋白基因SiC3H1,并对其在不同非生物逆境胁迫下的表达变化进行了研究。测序结果表明,SiC3H1基因编码序列长1 110 bp,编码369个氨基酸。对其编码蛋白进行序列分析发现,该蛋白含有2个CCCH型锌指结构域。进化树分析表明,SiC3H1与番茄和马铃薯中的同源基因相似度较高。启动子序列分析显示,SiC3H1启动子区域含有参与防御和胁迫应答的元件、脱落酸应答元件和乙烯应答元件。实时荧光定量PCR分析表明,在渗透、高盐、低温、高温和淹水5种逆境胁迫处理下,SiC3H1的表达量与对照相比均显著升高。以上研究结果表明,SiC3H1参与了芝麻对多种逆境胁迫的应答反应,为今后进一步解析其功能提供了理论依据。

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【文章目录】：
1 结果与分析
    1.1 Si C3H1的克隆与基本理化性质分析
    1.2 Si C3H1亚细胞定位分析
    1.3 Si C3H1保守结构域分析
    1.4 同源蛋白序列比对及进化分析
    1.5 Si C3H1基因启动子序列分析
    1.6 Si C3H1响应逆境胁迫的表达分析
2 讨论
3 材料与方法
    3.1 试验材料
    3.2 材料处理及取样
    3.3 RNA提取和基因定量表达分析
    3.4 Si C3H1基因的克隆
    3.5 生物信息学分析



本文编号：3749377