分子分型技术在空肠弯曲菌鉴定中的应用

发布时间：2022-01-12 19:49

　　分子分型克服了传统表型分型方法分辨力、重复度和重现性低且费时费力的缺陷。近年来,一系列空肠弯曲菌的分子分型方法应运而生。本文对应用于空肠弯曲菌的PFGE、RFLP、RAPD、MLST、SNP、flaA-RFLP、PCR-DGGE、PCR-SSCP、核糖体分型等分子分型方法的原理、应用及优劣势进行了分析比较。 

【文章来源】：预防医学论坛. 2019,25(12)

【文章页数】：4 页

【文章目录】：
1 基于全基因组的分子分型方法
    1.1 脉冲场凝胶电泳(PFGE)
    1.2 扩增性片段长度多态性(AFLP)
    1.3 随机扩增片段长度多态性(RAPD)
2 基于多基因座的分型方法
    2.1 多位点序列分型(MLST)
    2.2 核心基因组多位点序列分型(core-genome MLST,cg-MLST)
    2.3 全基因组多位点序列分型(whole-genome MLST,wg-MLST)
    2.4 基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱((MALDI-TOF-MS)的分型方法
    2.5 单核苷酸多态性(SNP)分型
    2.6 基于毒力基因的脂低聚糖基因分型和二进制PCR分型(PCR binary typing)
    2.7 基于非编码重复序列的分型技术
3 基于单基因座的分型方法
    3.1 flaA限制性片段长度多态性(flaA-RFLP)
    3.2 PCR变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)
    3.3 基于PCR的单链构象多态性(PCR-SSCP)
    3.4 核糖体分型(Riotyping)


【参考文献】：
期刊论文
[1]福氏志贺菌PFGE和MLVA分子分型方法的应用与评价[J]. 杨劲松,陈爱平,陈建辉,罗朝晨,林杰,郑恩惠.  中国人兽共患病学报. 2019(03)
[2]深圳市腹泻患者、禽源和牛源空肠弯曲菌的脉冲场凝胶电泳分析[J]. 鞠长燕,马艳萍,张茂俊,胡鹏威,金玉娟,刘楚云,段永翔.  中国热带医学. 2018(11)
[3]深圳市龙岗区空肠弯曲菌的流行状况及分子分型[J]. 金玉娟,洪敏丽,吴洁,陈应坚,杨慧,黄飞雁,刘渠,甘莉萍.  中国热带医学. 2017(06)
[4]采用FAFLP对屠宰场鸡胴体分离的空肠弯曲菌的分子分型和溯源分析[J]. 胡冬梅,王明忠,曲萍,孙雨,董浩,赵柏林,王晓英,孙爱萍.  卫生研究. 2017(01)
[5]禽肉流通环节空肠弯曲菌污染及婴幼儿感染的研究[J]. 赖植发,司徒潮满,侯红斌,石向辉,曾华书,张勇,陈润莉.  中国预防医学杂志. 2014(04)

博士论文
[1]上海市部分医院致泻性大肠杆菌和弯曲菌临床分离株的耐药性与分子分型[D]. 潘海建.上海交通大学 2016

硕士论文
[1]白假丝酵母菌的耐药分析及其与抗氰呼吸的相关性研究[D]. 张晓梅.兰州大学 2010



本文编号：3585361