A3/A1复合物对接及结构域之间相互作用的分子动力学研究

发布时间：2024-06-28 21:04

　　目的探究血管性血友病因子(von Willbrand factor,v WF) A1、A3结构域间的相互作用及A3的2 M型突变W1745C对A3/A1热稳定性和机械稳定性的影响。方法 A1、A3的晶体结构取自PDB数据库,首先通过柔性对接获得WT-A3/A1(野生型)复合物结构;再利用计算机突变技术构建W1745C-A3/A1复合物体系;最后采用拉伸分子动力学模拟,观察接触面氢键和盐桥的形成与演化,对比分析WT-A3/A1与W1745C-A3/A1在复合物构象、解离力和解离时间的差异。结果 WT-A3/A1接触面之间存在5对生存率大于0. 2的氢键和1对生存率大于0. 5的盐桥; W1745C-A3突变提高了结合面氢键的生存率并增加1对稳定盐桥,从而能够抵抗更大的拉伸力,延缓A1/A3的解离。结论 v WF分子内部A1与A3的相互作用阻碍A1与血小板的结合,而W1745C-A3突变则强化这种分子内部的相互作用,降低A1对血小板的亲和力。研究结果为深入揭示临床中突变导致的血管性血友病的分子机制及相应药物研制提供参考。

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料
    1.2 分子对接
    1.3 分子动力学模拟
    1.4 恒速度拉伸分子动力学模拟
    1.5 数据分析
2 结果与讨论
    2.1 A3/A1分子对接结果及结合面的相互作用
    2.2 平衡过程中A3/A1复合物的稳定性
    2.3 突变体W1745C-A3/A1的构建及热稳定性
    2.4 W1745C型突变增强A3/A1复合物机械稳定性
3 讨论与展望



本文编号：3996670