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疫苗临床试验电子化数据管理软件开发研究

发布时间:2017-03-21 03:08

  本文关键词:疫苗临床试验电子化数据管理软件开发研究,,由笔耕文化传播整理发布。


【摘要】:目的数据管理是疫苗临床试验的一个重要步骤,数据管理的质量决定了统计分析能否顺利进行,进一步决定了研究结论的准确可靠性。为提高疫苗临床试验数据管理水平,在已有数据管理研究的基础上,继续研究统计分析计划书、标准化数据分库、自动化文本材料输出,达到整个数据管理过程的标准化、规范化、自动化以适应疫苗临床试验不同试验数据结构的要求。方法根据临床数据交换标准协会(Clinical Data Interchange Standards Consortium, CDISC)制定的原则,使用研究数据列表模型(Study Data Tabulation Model, SDTM)的命名规则,为标准化打下基础。通过SAS软件的宏程序和AF功能,编写数据管理过程中要求的各种功能,实现自动化。对不同疫苗临床试验的数据结构、变量、分析方案、文本制作进行归纳总结,找到共同部分加以固定,可变部分改用参数配置,达到规范化。在SAS宏和AF界面平台上,对已有的自动编盲、自动盲查模块加以改进整合,利用外部Excel进行参数配置,发挥Excel强大的编辑功能、与SAS对接良好、以及利于保存和互通的特性,新开发出统计分析计划书设计、SDTM域的分库提取、数据库锁定和揭盲中需要的文本输出功能,使得整个数据管理的步骤均被涵盖,并添加了一些数据处理时使用到的工具宏,满足数据操作时的各种要求,达到面向操作者的数据管理自动化实现,形成一套功能较为完整的数据管理软件。结果通过改进前期编写的电子化CRF数据库,规范了SDTM提取规则在疫苗临床试验上的应用,同时又为今后SDTM标准的改进提供了更新的窗口。通过编写数个适应不同提取规则的宏程序,达成了疫苗临床试验要求的人口学、安全性、免疫原性、合并用药等域的提取功能。对不同试验中统计表格进行总结归纳,得出了一套统计分析计划书表格的制作方法,并利用外部Excel配置参数的方法,十分灵活的定制统计分析表格的内嵌信息,以及所需要呈列的表格的定制列表。并通过rtf输出加工技术,使统计分析计划书能够在很大程度上自动化输出。通过对试验的锁库、揭盲步骤中需要编写的文本进行归纳,总结出一套通用程度高的文本模板,利用SAS template对rtf输出的规范控制,以及rtf代码的再编辑加工,使SAS能够输出与人工使用Office编辑的文件模板十分接近的rtf文本,满足试验文本的自动化输出要求。讨论目前SDTM标准在中国临床试验的应用仍处在摸索阶段,一部分变量、数据结构的设定仍然在收集专家意见,并且面向药物试验的SDTM标准在应用到疫苗试验的时候还会面临一些问题。可见SDTM标准的学习和应用还是一个长期过程。所以本软件在分库设计上对变量和提取规则的限定并不写进宏程序本身,而是预设了数种提取方式的宏程序。而对于分库必须使用的具体域的提取方式、包含变量、变量名及变量类型等信息,初步根据SDTM标准,草拟在一个外部Excel策略文件中,并可以随着在不同试验中的应用以及对SDTM的更深入理解,不断扩充和拓展。对于统计分析计划书、锁定揭盲交接单模块已实现了较高程度的自动化标准化,但也存在一些需要改进的问题。而电子化CRF数据字典受制于CSPro软件的版本限制,成为了数据管理过程中最短板,将是今后完善并发展数据管理软件的重点。结论利用CDISC标准,在数据结构、变量名、变量类型等多方面规范化疫苗临床试验的数据采集和储存方式,为程序的标准化打下基础。在此基础上,利用SAS软件的宏和AF界面,编写了大量程序和框架,实现了SDTM标准下域的提取,同时又保证了适应今后随着SDTM版本更新而做出改变的要求;统计分析计划书模块较高程度地完成了统计表格定制,灵活地通过多层Excel配置解决了各试验因年龄组、征集症状、接种针次的不同造成参数信息不同的问题;锁库、揭盲交接单的文本自动化输出节省了人力物力和时间,提高了效率,减少了人工编辑产生错误的可能性,同时规范了文本的格式。整个软件基于SAS/AF,实现界面参数配置与后台宏程序入口的连接,利用界面的操作友好性,方便了专业人员的操作使用,为疫苗临床试验数据管理自动化标准化的发展提供了支持。
【关键词】:疫苗临床试验 数据管理 标准化 自动化 SAS SDTM
【学位授予单位】:东南大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2015
【分类号】:R95;TP311.52
【目录】:
  • 摘要4-7
  • Abstract7-11
  • 第一章 前言11-14
  • 1.1 研究背景11-12
  • 1.2 临床试验数据管理发展形势12-13
  • 1.3 研究目的和内容13-14
  • 第二章 疫苗临床试验数据管理标准化14-21
  • 2.1 CDISC标准概述14-19
  • 2.1.1 SDTM标准要求14-18
  • 2.1.2 ADaM标准要求18-19
  • 2.2 疫苗临床试验数据库标准化19-21
  • 2.2.1 疫苗临床试验中包含的域19-20
  • 2.2.2 变量名标准化20-21
  • 第三章 数据管理标准化软件开发21-64
  • 3.1 软件开发工具21-24
  • 3.1.1 SAS宏21
  • 3.1.2 SAS AF/SCL21-24
  • 3.2 开发策略24-54
  • 3.2.1 已开发软件模块改进25-29
  • 3.2.2 统计分析计划书自动化输出系统29-41
  • 3.2.3 SDTM分库功能41-50
  • 3.2.4 锁定数据库/揭盲交接文件制作50-54
  • 3.3 软件结构54-64
  • 3.3.1 基础54-57
  • 3.3.2 工具57-58
  • 3.3.3 功能58-64
  • 第四章 讨论64-67
  • 4.1 优点和创新64-65
  • 4.2 尚需解决的问题65-67
  • 第五章 结论67-69
  • 参考文献69-72
  • 临床试验数据管理标准化的发展(综述)72-78
  • 参考文献76-78
  • 作者简介78
  • 硕士在读期间发表论文及成果78-79
  • 致谢79

【参考文献】

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本文编号:258928


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