PD-1/PD-L1蛋白—蛋白相互作用（PPI）调节剂的虚拟筛选及生物活性评价

发布时间：2024-03-20 02:24

　　研究背景通过增强免疫细胞功能以清除癌细胞的治疗手段——肿瘤免疫治疗,是继手术、放疗、化疗之后的一种突破性治疗方法,包括癌症疫苗、靶向抗体、过继细胞疗法(ACT)、免疫检查点抑制剂(ICB)、非特异性免疫调节剂等多种形式。免疫检查点分子通过产生免疫共抑制信号诱导细胞毒性T细胞无能,介导肿瘤免疫逃逸,是目前肿瘤免疫治疗的重要靶标。免疫检查点抑制剂通过阻断共抑制信号重新激活T细胞而杀伤肿瘤细胞,现已成功用于黑色素瘤等多种恶性肿瘤的治疗。其中,针对PD-1/PD-L1信号通路的抗体药物发展最为迅速,已有Avelumab等多个单克隆抗体药物上市。其存在的局限性包括不良的组织及肿瘤渗透性,较长的半衰期,不良的口服生物利用度以及昂贵的生产成本,阻碍了它们的广泛临床应用。而拥有大大降低生产成本、稳定性良好、较小免疫原性副作用等固有优势的小分子抑制剂,有望成为抗体药物的有效替代品或补充。研究目的本课题基于PD-1、PD-L1结构开展多肽及小分子的虚拟筛选研究,结合分子模拟技术发现理论候选化合物并分析结合模式,通过表面等离子共振(SPR)竞争性分析及生物活性测定评价其抗肿瘤活性,以期发现具有潜在应用价值的...

【文章页数】：116 页

【学位级别】：硕士

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摘要
Abstract
英文缩略词表
1 绪言
    1.1 肿瘤的发生
        1.1.1 肿瘤的发生
        1.1.2 肿瘤微环境
        1.1.3 肿瘤的免疫逃逸
    1.2 肿瘤的免疫治疗
    1.3 免疫检查点
    1.4 PD-1/PD-L1 信号通路的研究进展
    1.5 研究的选题
        1.5.1 选题意义
        1.5.2 拟解决的问题
        1.5.3 主要技术路线
2 基于PD-1的PPI多肽调节剂的虚拟筛选
    2.1 计算机虚拟筛选概述
        2.1.1 计算机辅助药物设计
        2.1.2 虚拟筛选
        2.1.3 分子对接
        2.1.4 同源模建
    2.2 人源PD-1/PD-L1 复合物晶体结构分析
    2.3 材料与方法
        2.3.1 实验材料
        2.3.2 实验方法
    2.4 结果与讨论
        2.4.1 同源模建
        2.4.2 基于分子对接的虚拟筛选
        2.4.3 多肽与PD-1 蛋白结合模式分析
    2.5 本章小结
3 PPI多肽调节剂的合成、SPR分析及生物活性评价
    3.1 多肽调节剂的合成
        3.1.1 实验原理
        3.1.2 实验方法
        3.1.3 实验结果
    3.2 多肽与PD-1的SPR分析
        3.2.1 实验仪器与试剂
        3.2.2 实验原理与方法
        3.2.3 SPR结果分析
    3.3 多肽与PD-1/PD-L1 的竞争结合试验
        3.3.1 实验方法
        3.3.2 竞争性实验结果
    3.4 多肽调节剂的生物活性评价
        3.4.1 T细胞活化试验
        3.4.2 T细胞细胞毒性试验
    3.5 本章小结
4 PPI小分子调节剂的虚拟筛选
    4.1 PPI小分子调节剂的分子对接
        4.1.1 靶向PD-1 小分子调节剂的虚拟筛选
        4.1.2 以PD-L1 为靶点的小分子调节剂的虚拟筛选
    4.2 PPI调节剂的分子动力学模拟
        4.2.1 分子动力学模拟的概论
        4.2.2 实验方法
        4.2.3 实验结果
    4.3 本章小结
5 小分子调节剂的SPR分析及生物活性评价
    5.1 小分子调节剂与PD-1/PD-L1的SPR分析
        5.1.1 实验方法
        5.1.2 实验结果与分析
    5.2 基于SPR的竞争性结合试验
        5.2.1 实验方法
        5.2.2 竞争性实验结果
    5.3 小分子调节剂的生物活性评价
        5.3.1 T细胞活化试验
        5.3.2 T细胞细胞毒性试验
    5.4 本章小结
6 全文总结
    6.1 全文总结
    6.2 工作展望
致谢
参考文献
附录1
附录2
附录3
个人简历、在校期间发表的学术论文及取得的研究成果



本文编号：3932814