基于液相色谱质谱联用技术的大肠癌血、尿代谢谱特征研究

发布时间：2017-07-01 05:05

  本文关键词：基于液相色谱质谱联用技术的大肠癌血、尿代谢谱特征研究，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：目的： 通过用高效液相色谱质谱联用技术分别对大肠癌患者和健康人血液、尿液进行检测，并运用多种统计方法对所得到的数据进行统计分析，考察存在于大肠癌患者和健康人之间的代谢物差异，寻找与大肠癌相关的潜在生物标记物，同时检验这些标记物对区分大肠癌患者和健康人的准确性，为寻找大肠癌新的肿瘤标志物和药物靶点提供科学依据。 方法： 1、样本处理：对血液、尿液样本进行高速离心(14000rpm,5min)等处理，取上清液供高效液相色谱质谱联用仪检测分析，以保证代谢图谱的完整性。 2、LC-MS分析：采用高效液相色谱飞行时间质谱联用仪（HPLC-TOFMS）对样本进行检测，获得大肠癌患者和健康人血液、尿液各样本的代谢图谱及数据。 3、数据分析：运用聚类分析（cluster analysis,CA）、主成分分析（principalcomponent analysis，PCA）、偏最小二乘判别分析（partial least square-discriminantanalysis, PLS-DA）、t检验等统计方法对实验所得到的数据进行分析，检验大肠癌患者和健康人之间的差异代谢，并找出对区分两组贡献较大的代谢物，同时检验这些代谢物对大肠癌判别的准确性。 结果： 1、在血液样本的研究中，从PCA得分图（score plot）可以看到大肠癌患者组和健康人组可以分离开，通过t检验等统计学分析在正负离子模式下一共找到了18个对区分两组贡献较大的重要差异代谢物。通过ROC曲线法和均值柱状图最终找到了6个关键差异代谢物作为大肠癌的潜在生物标记物，同时验证了这些生物标记物对区分大肠癌组与正常组有很高的准确性和特异性。 2、在尿液样本的研究中，同样运用PCA法对实验数据进行分析，从得分图中可以看到大肠癌患者组和健康人组可以分离开，经统计学分析在正负离子模式下共得到了19个重要差异代谢物。通过ROC曲线法和均值柱状图最终找到了8个关键差异代谢物作为大肠癌的潜在生物标记物，同时验证了这些生物标记物对区分大肠癌与正常组有很高的准确性和特异性。 结论： 本研究用高效液相色谱质谱联用技术分别对大肠癌患者和健康人血液、尿液进行代谢组学研究，获得大肠癌患者和健康人的代谢图谱，运用多种统计学分析方法分析得到了可作为大肠癌潜在生物标记物的代谢物，并通过实验证明了这些标记物对区分大肠癌与正常组有很高的准确性和特异性。同时本研究证明了代谢组学是研究癌症的强有力的工具。
【关键词】：大肠癌 代谢组学 高效液相色谱-飞行时间质谱联用
【学位授予单位】：吉林大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R735.34
【目录】：

• 前言4-6
• 中文摘要6-8
• ABSTRACT8-13
• 第1章 综述13-22
• 1.1 代谢组学概述13
• 1.2 代谢组学的发展13
• 1.3 代谢组学的研究层次13-14
• 1.4 代谢组学的研究方法14-20
• 1.4.1 样本的采集14-15
• 1.4.2 样本的预处理15
• 1.4.3 样本的分析方法15-18
• 1.4.4 数据处理方法和代谢物分析18-20
• 1.5 代谢组学在肿瘤诊断中的应用20-21
• 1.6 展望21-22
• 第2章 基于 HPLC-TOFMS 大肠癌血液代谢组学研究22-36
• 2.1 引言22
• 2.2 实验部分22-26
• 2.2.1 实验流程图22-23
• 2.2.2 实验材料、试剂与仪器23
• 2.2.3 样本来源23
• 2.2.4 样本处理23-24
• 2.2.5 分析条件24-25
• 2.2.6 数据处理25
• 2.2.7 生物标记物的分析25-26
• 2.3 实验结果26-33
• 2.3.1 实验组和对照组血样的 LC-MS 总离子流图26
• 2.3.2 数据分析结果26-30
• 2.3.3 代谢物的结构鉴定30-31
• 2.3.4 关键差异代谢物的发现31-33
• 2.3.5 寻找差异代谢物相关代谢路径33
• 2.4 讨论33-34
• 2.5 小结34-36
• 第3章 基于 HPLC-TOFMS 大肠癌尿液代谢组学研究36-46
• 3.1 引言36
• 3.2 实验部分36
• 3.2.1 实验流程图36
• 3.2.2 实验材料、试剂与仪器36
• 3.2.3 样本来源36
• 3.2.4 样本处理36
• 3.2.5 分析条件36
• 3.2.6 数据处理36
• 3.2.7 生物标记物的分析36
• 3.3 实验结果36-44
• 3.3.1 实验组和对照组尿样的 LC-MS 总离子流图36-37
• 3.3.2 数据分析结果37-41
• 3.3.3 代谢物的结构鉴定41-42
• 3.3.4 关键差异代谢物的发现42-43
• 3.3.5 寻找差异代谢物相关代谢路径43-44
• 3.4 讨论44-45
• 3.5 小结45-46
• 第4章 总结与展望46-47
• 4.1 总结46
• 4.2 展望46-47
• 参考文献47-53
• 附表53-63
• 作者简介及在学期间所取得的科研成果63-64
• 致谢64

【参考文献】

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1 张瑜;高一萌;李文燕;彭慧娟;刘斌;王辉;令狐华;;鸟嘌呤核苷交换因子Dock180与Elmo1在卵巢癌细胞中的共表达[J];第三军医大学学报;2012年13期

  本文关键词：基于液相色谱质谱联用技术的大肠癌血、尿代谢谱特征研究，，由笔耕文化传播整理发布。

本文编号：504633