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非整倍体对异源六倍体小麦全基因组范围内基因表达的影响

发布时间:2024-04-09 01:02
  基因复制是获得新基因的主要途径,它的发生会导致本身剂量的改变。基因复制最大可达到全基因组的复制,形成多倍体;也可以小到单个基因的复制,但是当多个连续基因的复制就形成了非整倍体。因此多倍化和非整倍化都可能对新基因的产生做出贡献。研究表明,在新合成的异源多倍体中常常伴随着大量的非整倍体的出现,包括染色体数目的变化和染色体结构的变化。为什么会出现非整倍体?非整倍体的出现是不同物种杂交冲击的偶然事件,还是异源多倍化物种形成过程中的必然产物,目前仍然没有明确的答案。虽然伴随异源多倍化产生的非整倍体的事件已经被报道,但是其在基因表达水平的变化还鲜有研究。本文以异源多倍体的模式物种小麦(Triticum aestivum L.)为背景,基于传统的遗传学手段创制的不同类型的小麦非整倍体,主要以部分同源染色体组1的染色体数目变化为主,利用FISH/GISH技术与转录组测序相结合的方法,试图揭示异源多倍体物种是如何应答非整倍化事件的发生。通过对测序结果中不同层级的划分,探究非整倍化在多倍化背景下所产生的影响及其表型结果。本研究表明,在转录水平上,非整倍化的发生能够使异源六倍体小麦引起全局的响应,主要受顺式...

【文章页数】:89 页

【学位级别】:博士

【部分图文】:

图1.1.非整倍体中观察到的基因表达效应类型的图示

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图1.1.非整倍体中观察到的基因表达效应类型的图示[22]igure1.1.Diagrammaticrepresentationofthetypesofeffectsobservedforgeneexpressioaneuploids[22]倍化与表型....


图2.1.所有小麦非整倍体及其整倍体萌发15天的幼苗植株

图2.1.所有小麦非整倍体及其整倍体萌发15天的幼苗植株

图2.1.所有小麦非整倍体及其整倍体萌发15天的幼苗植株。比例尺是1.8cm。Figure2.1.SeedlingsoftheallaneuploidstrainsandtheircommoneuploidCSat15daysafter....


图2.2.转录组数据的概括

图2.2.转录组数据的概括

图2.2.转录组数据的概括。Figure2.2.SummaryoftheRNA-seqdataset.析stqc软件包评估原始数据(rawdata)的质量,然后去掉低质量得高质量的数据(cleanreads)。基于Tophat2.0软件将其与ts.ens....


图2.3.所有转录组数据的比对详情

图2.3.所有转录组数据的比对详情

图2.3.所有转录组数据的比对详情。Figure2.3.SummaryofnumberofreadpairsforeachRNA-seqsample.剂量补偿的分析量补偿,指的是即使基因拷贝数已经发生了改变,但是其基因的表达量维持在本实验材料中,选取涉及....



本文编号:3949076

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