CiWRKY17基因克隆与生物信息学分析

发布时间：2022-11-06 15:54

　　本研究主要目的是克隆中间锦鸡儿WRKY17转录因子并对其编码蛋白的理化性质及结构特征进行生物学特性分析。首先对CiWRKY17进行基因克隆,其次将PCR扩增后得到的全长连接到克隆载体上,最后利用生物信息学工具分析CiWRKY17等蛋白的生物学特性。结果显示,CiWRKY17基因全长957 bp,编码318个氨基酸残基,此蛋白属于WRKY超家族中IId亚家族（组）的成员,是位于细胞核中的稳定亲水性蛋白,其二级结构主要由无规则卷曲、α-螺旋和β-折叠构成,其中无规则卷曲为二级结构中最主要的结构元件,并且二级结构与三级结构预测结果高度一致。最后得出结论,这8种不同植物中的WRKY17转录因子具有高度相似的结构和特征,因此应均具有与盐胁迫相关的抗性。 

【文章页数】：9 页

【文章目录】：
1 结果与分析
    1.1 Ci WRKY17基因的克隆
    1.2 Ci WRKY17的同源性分析及系统发育树构建
    1.3 Ci WRKY17的蛋白结构分析
        1.3.1 WRKY17蛋白一级结构与理化性分析
        1.3.2 WRKY17疏水性分析
        1.3.3 WRKY17蛋白亚细胞定位分析
        1.3.4 WRKY17蛋白二级和三级结构预测分析
2 讨论
3 材料与方法
    3.1 实验材料
    3.2 序列来源
    3.3 中间锦鸡儿叶片组织总RNA提取及反转录
    3.4 引物的设计
    3.5 PCR的扩增
    3.6 目的基因的转化连接
    3.7 菌落PCR鉴定
    3.8 生物信息学分析
作者贡献


【参考文献】：
期刊论文
[1]响应镉胁迫的水稻WRKY15转录因子基因的分离与表达特征[J]. 彭喜旭,白宁宁,王海华.  中国水稻科学. 2018(02)
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[4]鄂尔多斯中间锦鸡儿研究利用综述[J]. 白春利,赵和平,贾明,丁海君.  畜牧与饲料科学. 2016(08)
[5]不同品系小麦的耐盐性研究[J]. 马林,任崴,陈小梅,周丛梅.  新疆农业大学学报. 2014(02)
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[7]小麦种质芽期和苗期的耐盐性鉴定评价[J]. 张巧凤,陈宗金,吴纪中,蒋彦婕,杨继书,蔡士宾.  植物遗传资源学报. 2013(04)
[8]小麦的耐盐性及其改良研究进展[J]. 裴自友,温辉芹,任永康,王晋,庄丽芳.  作物研究. 2012(01)
[9]WRKY转录因子功能研究进展[J]. 张娟.  西北植物学报. 2009(10)
[10]中国锦鸡儿属植物资源研究——分布及分种描述[J]. 牛西午.  西北植物学报. 1999(05)



本文编号：3703782