生姜对新型冠状病毒肺炎的防治作用探讨
发布时间：2022-01-10 12:53
采用药物生物信息学方法探讨生姜防治2019年新型冠状病毒疾病（COVID-19）的作用机制。以生姜3种活性成分（6-姜辣素、8-姜酚和10-姜酚）为研究对象,采用化学相似性搜索方法预测潜在作用靶蛋白,同时采用人工数据挖掘病毒性肺炎疾病相关蛋白,并用String 11.0构建蛋白相互作用网络。由交集获得生姜活性治疗病毒性肺炎疾病的核心靶蛋白,通过Omicshare和DAVID数据库分别对核心靶蛋白的基因本体富集和KEGG通路分析,采用Cytoscape构建生姜"活性成分-靶点-通路"网络图。结果显示,生姜活性成分涉及168个靶点,病毒性肺炎疾病相关蛋白有253个。由交集获得的18个核心靶蛋白与生姜防治病毒性肺炎相关。GO富集分析表明核心蛋白作用与炎症反应和免疫调节、细胞因子介导受体等有关。核心靶蛋白参与的KEGG通路有21条,涉及病毒感染、趋化因子通路和众多癌症通路等。研究结果表明生姜活性成分是通过多靶点和多通路对机体起整体调控作用。本研究为生姜防控COVID-19提供理论依据,也为饮食调理提供参考。
【文章来源】：中国食品学报. 2020,20(12)北大核心EICSCD
【文章页数】：9 页
【部分图文】：
活性成分的预测靶蛋白分布饼图
图1 活性成分的预测靶蛋白分布饼图在Drug Bank数据库中分别查到小分子药物丁螺环酮（Buspirone），齐留通（Ziltuton）和甲泼尼龙（Methylprednisolone）可分别作用于HTR1A,ALOX5和HSD11B1蛋白。将这3个小分子药物的SMILE化学结构上传到Swiss Target Prediction进行预测，可发现目标蛋白在预测结果中分别排第4位，第1位和第13位（表2），说明Swiss Target Prediction方法学具有较高的准确性。
以“viral pneumonia”为关键词，从CTD数据库中检索并审核得到34个病毒性肺炎疾病相关蛋白集。同样从Gene Card数据库中检索到4 078个原始数据，为提高准确度和减少工作量，本研究以相关性得分>15筛选并删掉重复值等，确定239个疾病相关蛋白集。这2个蛋白集合并，最终获得253个与病毒性肺炎疾病相关的蛋白。这253个构成了一个非常复杂的蛋白相互作用网络（图2）。表3列有其涉及到的前10种生物过程，均与免疫系统调节和细胞因子反应等密切相关。2.3 生姜活性成分防治病毒性肺炎的靶点确认
【参考文献】：
期刊论文
[1]Molecular immune pathogenesis and diagnosis of COVID-19[J]. Xiaowei Li,Manman Geng,Yizhao Peng,Liesu Meng,Shemin Lu. Journal of Pharmaceutical Analysis. 2020(02)
[2]新型冠状病毒肺炎防治中的辛开苦降之法[J]. 庞稳泰,张立双,杨丰文,黄明,郑文科,张俊华,张伯礼. 中华中医药学刊. 2020(03)
[3]新型冠状病毒肺炎中医病理研究[J]. 张云飞,赵鹏飞,沈体雁. 中医学报. 2020(04)
[4]中药预防新型冠状病毒肺炎策略与分析[J]. 倪力强,陶弘武,杨小林,张杰,倪行健. 中华中医药学刊. 2020(04)
[5]基于数据挖掘的《瘟疫论》《广瘟疫论》用药规律分析[J]. 王赛,白明,苗明三. 中药药理与临床. 2020(02)
[6]抗新型冠状病毒方剂基于花生四烯酸代谢通路防治“细胞因子风暴”的研究[J]. 任越,姚美村,霍晓乾,谷宇,朱卫星,乔延江,张燕玲. 中国中药杂志. 2020(06)
[7]张伯礼：中医药在防治新型冠状病毒肺炎全过程发挥作用[J]. 高树明,马英,杨丰文,张俊华,于春泉. 天津中医药. 2020(02)
[8]中医药防治新型冠状病毒肺炎方证规律分析[J]. 庞稳泰,金鑫瑶,庞博,杨丰文,王辉,刘春香,郑文科,张俊华. 中国中药杂志. 2020(06)
[9]基于Mpro和PLP筛选潜在抗新型冠状病毒中药研究[J]. 马婧,霍晓乾,陈茜,朱卫星,姚美村,乔延江,张燕玲. 中国中药杂志. 2020(06)
[10]基于临床经验和分子对接技术的抗新型冠状病毒中医组方快速筛选模式及应用[J]. 牛明,王睿林,王仲霞,张萍,柏兆方,景婧,郭玉明,赵旭,湛小燕,张子腾,宋雪艾,秦恩强,王伽伯,肖小河. 中国中药杂志. 2020(06)
本文编号：3580750
【文章来源】：中国食品学报. 2020,20(12)北大核心EICSCD
【文章页数】：9 页
【部分图文】：
活性成分的预测靶蛋白分布饼图
图1 活性成分的预测靶蛋白分布饼图在Drug Bank数据库中分别查到小分子药物丁螺环酮（Buspirone），齐留通（Ziltuton）和甲泼尼龙（Methylprednisolone）可分别作用于HTR1A,ALOX5和HSD11B1蛋白。将这3个小分子药物的SMILE化学结构上传到Swiss Target Prediction进行预测，可发现目标蛋白在预测结果中分别排第4位，第1位和第13位（表2），说明Swiss Target Prediction方法学具有较高的准确性。
以“viral pneumonia”为关键词，从CTD数据库中检索并审核得到34个病毒性肺炎疾病相关蛋白集。同样从Gene Card数据库中检索到4 078个原始数据，为提高准确度和减少工作量，本研究以相关性得分>15筛选并删掉重复值等，确定239个疾病相关蛋白集。这2个蛋白集合并，最终获得253个与病毒性肺炎疾病相关的蛋白。这253个构成了一个非常复杂的蛋白相互作用网络（图2）。表3列有其涉及到的前10种生物过程，均与免疫系统调节和细胞因子反应等密切相关。2.3 生姜活性成分防治病毒性肺炎的靶点确认
【参考文献】：
期刊论文
[1]Molecular immune pathogenesis and diagnosis of COVID-19[J]. Xiaowei Li,Manman Geng,Yizhao Peng,Liesu Meng,Shemin Lu. Journal of Pharmaceutical Analysis. 2020(02)
[2]新型冠状病毒肺炎防治中的辛开苦降之法[J]. 庞稳泰,张立双,杨丰文,黄明,郑文科,张俊华,张伯礼. 中华中医药学刊. 2020(03)
[3]新型冠状病毒肺炎中医病理研究[J]. 张云飞,赵鹏飞,沈体雁. 中医学报. 2020(04)
[4]中药预防新型冠状病毒肺炎策略与分析[J]. 倪力强,陶弘武,杨小林,张杰,倪行健. 中华中医药学刊. 2020(04)
[5]基于数据挖掘的《瘟疫论》《广瘟疫论》用药规律分析[J]. 王赛,白明,苗明三. 中药药理与临床. 2020(02)
[6]抗新型冠状病毒方剂基于花生四烯酸代谢通路防治“细胞因子风暴”的研究[J]. 任越,姚美村,霍晓乾,谷宇,朱卫星,乔延江,张燕玲. 中国中药杂志. 2020(06)
[7]张伯礼：中医药在防治新型冠状病毒肺炎全过程发挥作用[J]. 高树明,马英,杨丰文,张俊华,于春泉. 天津中医药. 2020(02)
[8]中医药防治新型冠状病毒肺炎方证规律分析[J]. 庞稳泰,金鑫瑶,庞博,杨丰文,王辉,刘春香,郑文科,张俊华. 中国中药杂志. 2020(06)
[9]基于Mpro和PLP筛选潜在抗新型冠状病毒中药研究[J]. 马婧,霍晓乾,陈茜,朱卫星,姚美村,乔延江,张燕玲. 中国中药杂志. 2020(06)
[10]基于临床经验和分子对接技术的抗新型冠状病毒中医组方快速筛选模式及应用[J]. 牛明,王睿林,王仲霞,张萍,柏兆方,景婧,郭玉明,赵旭,湛小燕,张子腾,宋雪艾,秦恩强,王伽伯,肖小河. 中国中药杂志. 2020(06)
本文编号：3580750
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